Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES34

Ube3b, Ubiquitin-protein ligase E3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3bQ9ES34 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube3bQ9ES34 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube3bQ9ES34 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube3bQ9ES34 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube3bQ9ES34 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube3bQ9ES34 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube3bQ9ES34 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube3bQ9ES34 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube3bQ9ES34 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube3bQ9ES34 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube3bQ9ES34 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube3bQ9ES34 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube3bQ9ES34 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube3bQ9ES34 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube3bQ9ES34 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube3bQ9ES34 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube3bQ9ES34 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube3bQ9ES34 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube3bQ9ES34 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube3bQ9ES34 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube3bQ9ES34 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube3bQ9ES34 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube3bQ9ES34 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube3bQ9ES34 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube3bQ9ES34 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube3bQ9ES34 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube3bQ9ES34 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube3bQ9ES34 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube3bQ9ES34 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube3bQ9ES34 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube3bQ9ES34 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube3bQ9ES34 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube3bQ9ES34 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube3bQ9ES34 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube3bQ9ES34 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube3bQ9ES34 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube3bQ9ES34 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube3bQ9ES34 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube3bQ9ES34 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube3bQ9ES34 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube3bQ9ES34 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube3bQ9ES34 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube3bQ9ES34 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube3bQ9ES34 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube3bQ9ES34 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube3bQ9ES34 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube3bQ9ES34 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube3bQ9ES34 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube3bQ9ES34 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube3bQ9ES34 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube3bQ9ES34 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube3bQ9ES34 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube3bQ9ES34 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube3bQ9ES34 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube3bQ9ES34 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube3bQ9ES34 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube3bQ9ES34 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube3bQ9ES34 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube3bQ9ES34 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube3bQ9ES34 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube3bQ9ES34 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube3bQ9ES34 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube3bQ9ES34 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube3bQ9ES34 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube3bQ9ES34 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube3bQ9ES34 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube3bQ9ES34 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube3bQ9ES34 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube3bQ9ES34 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube3bQ9ES34 Gm38116-201ENSMUST00000193873 1533 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube3bQ9ES34 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube3bQ9ES34 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube3bQ9ES34 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube3bQ9ES34 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube3bQ9ES34 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube3bQ9ES34 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube3bQ9ES34 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube3bQ9ES34 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube3bQ9ES34 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube3bQ9ES34 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube3bQ9ES34 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube3bQ9ES34 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube3bQ9ES34 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube3bQ9ES34 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube3bQ9ES34 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube3bQ9ES34 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube3bQ9ES34 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube3bQ9ES34 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube3bQ9ES34 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube3bQ9ES34 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube3bQ9ES34 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube3bQ9ES34 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube3bQ9ES34 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube3bQ9ES34 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube3bQ9ES34 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube3bQ9ES34 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube3bQ9ES34 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube3bQ9ES34 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube3bQ9ES34 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube3bQ9ES34 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms