Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Clstn2Q9ER65 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Clstn2Q9ER65 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Clstn2Q9ER65 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Clstn2Q9ER65 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Clstn2Q9ER65 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Clstn2Q9ER65 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Clstn2Q9ER65 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Clstn2Q9ER65 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Clstn2Q9ER65 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Clstn2Q9ER65 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Clstn2Q9ER65 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Clstn2Q9ER65 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Clstn2Q9ER65 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Clstn2Q9ER65 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Clstn2Q9ER65 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Clstn2Q9ER65 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Clstn2Q9ER65 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Clstn2Q9ER65 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Clstn2Q9ER65 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Clstn2Q9ER65 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Clstn2Q9ER65 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Clstn2Q9ER65 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Clstn2Q9ER65 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Clstn2Q9ER65 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Clstn2Q9ER65 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Clstn2Q9ER65 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Clstn2Q9ER65 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Clstn2Q9ER65 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Clstn2Q9ER65 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Clstn2Q9ER65 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Clstn2Q9ER65 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Clstn2Q9ER65 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Clstn2Q9ER65 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Clstn2Q9ER65 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Clstn2Q9ER65 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Clstn2Q9ER65 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Clstn2Q9ER65 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Clstn2Q9ER65 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Clstn2Q9ER65 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Clstn2Q9ER65 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Clstn2Q9ER65 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Clstn2Q9ER65 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Clstn2Q9ER65 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Clstn2Q9ER65 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Clstn2Q9ER65 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Clstn2Q9ER65 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Clstn2Q9ER65 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Clstn2Q9ER65 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Clstn2Q9ER65 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Clstn2Q9ER65 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Clstn2Q9ER65 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Clstn2Q9ER65 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Clstn2Q9ER65 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Clstn2Q9ER65 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Clstn2Q9ER65 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Clstn2Q9ER65 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Clstn2Q9ER65 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Clstn2Q9ER65 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Clstn2Q9ER65 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Clstn2Q9ER65 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Clstn2Q9ER65 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Clstn2Q9ER65 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Clstn2Q9ER65 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Clstn2Q9ER65 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Clstn2Q9ER65 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Clstn2Q9ER65 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Clstn2Q9ER65 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Clstn2Q9ER65 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Clstn2Q9ER65 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Clstn2Q9ER65 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Clstn2Q9ER65 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Clstn2Q9ER65 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Clstn2Q9ER65 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Clstn2Q9ER65 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Clstn2Q9ER65 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Clstn2Q9ER65 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Clstn2Q9ER65 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Clstn2Q9ER65 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Clstn2Q9ER65 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Clstn2Q9ER65 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Clstn2Q9ER65 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Clstn2Q9ER65 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Clstn2Q9ER65 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Clstn2Q9ER65 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Clstn2Q9ER65 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Clstn2Q9ER65 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Clstn2Q9ER65 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Clstn2Q9ER65 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Clstn2Q9ER65 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Clstn2Q9ER65 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Clstn2Q9ER65 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Clstn2Q9ER65 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Clstn2Q9ER65 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Clstn2Q9ER65 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Clstn2Q9ER65 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Clstn2Q9ER65 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Clstn2Q9ER65 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Clstn2Q9ER65 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Clstn2Q9ER65 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms