Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC28

Csnk1d, Casein kinase I isoform delta, mousemouse

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1dQ9DC28 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
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Csnk1dQ9DC28 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Csnk1dQ9DC28 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Csnk1dQ9DC28 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Csnk1dQ9DC28 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Csnk1dQ9DC28 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Csnk1dQ9DC28 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Csnk1dQ9DC28 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Csnk1dQ9DC28 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Csnk1dQ9DC28 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Csnk1dQ9DC28 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Csnk1dQ9DC28 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Csnk1dQ9DC28 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Csnk1dQ9DC28 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Csnk1dQ9DC28 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Csnk1dQ9DC28 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Csnk1dQ9DC28 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Csnk1dQ9DC28 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Csnk1dQ9DC28 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Csnk1dQ9DC28 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Csnk1dQ9DC28 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Csnk1dQ9DC28 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Csnk1dQ9DC28 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Csnk1dQ9DC28 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Csnk1dQ9DC28 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Csnk1dQ9DC28 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Csnk1dQ9DC28 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Csnk1dQ9DC28 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Csnk1dQ9DC28 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Csnk1dQ9DC28 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Csnk1dQ9DC28 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Csnk1dQ9DC28 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Csnk1dQ9DC28 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Csnk1dQ9DC28 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Csnk1dQ9DC28 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Csnk1dQ9DC28 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Csnk1dQ9DC28 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Csnk1dQ9DC28 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Csnk1dQ9DC28 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Csnk1dQ9DC28 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Csnk1dQ9DC28 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Csnk1dQ9DC28 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Csnk1dQ9DC28 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Csnk1dQ9DC28 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Csnk1dQ9DC28 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Csnk1dQ9DC28 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Csnk1dQ9DC28 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Csnk1dQ9DC28 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Csnk1dQ9DC28 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Csnk1dQ9DC28 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Csnk1dQ9DC28 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Csnk1dQ9DC28 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Csnk1dQ9DC28 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Csnk1dQ9DC28 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Csnk1dQ9DC28 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Csnk1dQ9DC28 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Csnk1dQ9DC28 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Csnk1dQ9DC28 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Csnk1dQ9DC28 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Csnk1dQ9DC28 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Csnk1dQ9DC28 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Csnk1dQ9DC28 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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