Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB28

Pop5, Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5, mousemouse

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop5Q9DB28 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Pop5Q9DB28 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Pop5Q9DB28 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Pop5Q9DB28 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Pop5Q9DB28 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Pop5Q9DB28 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Pop5Q9DB28 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Pop5Q9DB28 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Pop5Q9DB28 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Pop5Q9DB28 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pop5Q9DB28 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pop5Q9DB28 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pop5Q9DB28 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pop5Q9DB28 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pop5Q9DB28 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pop5Q9DB28 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pop5Q9DB28 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pop5Q9DB28 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pop5Q9DB28 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pop5Q9DB28 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pop5Q9DB28 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pop5Q9DB28 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pop5Q9DB28 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pop5Q9DB28 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pop5Q9DB28 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pop5Q9DB28 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pop5Q9DB28 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pop5Q9DB28 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pop5Q9DB28 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Pop5Q9DB28 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pop5Q9DB28 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Pop5Q9DB28 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Pop5Q9DB28 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pop5Q9DB28 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pop5Q9DB28 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pop5Q9DB28 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pop5Q9DB28 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pop5Q9DB28 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pop5Q9DB28 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pop5Q9DB28 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pop5Q9DB28 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pop5Q9DB28 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pop5Q9DB28 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pop5Q9DB28 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pop5Q9DB28 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pop5Q9DB28 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pop5Q9DB28 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pop5Q9DB28 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pop5Q9DB28 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pop5Q9DB28 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pop5Q9DB28 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pop5Q9DB28 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pop5Q9DB28 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pop5Q9DB28 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pop5Q9DB28 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pop5Q9DB28 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pop5Q9DB28 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pop5Q9DB28 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pop5Q9DB28 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pop5Q9DB28 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pop5Q9DB28 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
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Pop5Q9DB28 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pop5Q9DB28 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
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Pop5Q9DB28 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pop5Q9DB28 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pop5Q9DB28 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pop5Q9DB28 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pop5Q9DB28 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Pop5Q9DB28 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pop5Q9DB28 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pop5Q9DB28 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pop5Q9DB28 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pop5Q9DB28 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pop5Q9DB28 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pop5Q9DB28 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pop5Q9DB28 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pop5Q9DB28 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pop5Q9DB28 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pop5Q9DB28 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pop5Q9DB28 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pop5Q9DB28 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pop5Q9DB28 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pop5Q9DB28 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pop5Q9DB28 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pop5Q9DB28 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pop5Q9DB28 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pop5Q9DB28 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pop5Q9DB28 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pop5Q9DB28 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pop5Q9DB28 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pop5Q9DB28 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pop5Q9DB28 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms