Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U8

Snx5, Sorting nexin-5, mousemouse

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Length 404 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx5Q9D8U8 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Snx5Q9D8U8 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Snx5Q9D8U8 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Snx5Q9D8U8 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Snx5Q9D8U8 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Snx5Q9D8U8 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Snx5Q9D8U8 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Snx5Q9D8U8 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Snx5Q9D8U8 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Snx5Q9D8U8 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Snx5Q9D8U8 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Snx5Q9D8U8 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Snx5Q9D8U8 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Snx5Q9D8U8 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Snx5Q9D8U8 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Snx5Q9D8U8 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Snx5Q9D8U8 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Snx5Q9D8U8 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Snx5Q9D8U8 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Snx5Q9D8U8 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Snx5Q9D8U8 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Snx5Q9D8U8 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Snx5Q9D8U8 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Snx5Q9D8U8 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Snx5Q9D8U8 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Snx5Q9D8U8 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Snx5Q9D8U8 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Snx5Q9D8U8 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Snx5Q9D8U8 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Snx5Q9D8U8 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Snx5Q9D8U8 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Snx5Q9D8U8 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Snx5Q9D8U8 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Snx5Q9D8U8 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Snx5Q9D8U8 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Snx5Q9D8U8 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Snx5Q9D8U8 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
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Snx5Q9D8U8 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Snx5Q9D8U8 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Snx5Q9D8U8 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Snx5Q9D8U8 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Snx5Q9D8U8 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Snx5Q9D8U8 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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Snx5Q9D8U8 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Snx5Q9D8U8 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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Snx5Q9D8U8 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Snx5Q9D8U8 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Snx5Q9D8U8 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Snx5Q9D8U8 Rangap1-201ENSMUST00000052374 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Snx5Q9D8U8 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
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Snx5Q9D8U8 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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Snx5Q9D8U8 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
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Snx5Q9D8U8 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Snx5Q9D8U8 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Snx5Q9D8U8 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Snx5Q9D8U8 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.48
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Snx5Q9D8U8 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Snx5Q9D8U8 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Snx5Q9D8U8 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Snx5Q9D8U8 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
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Snx5Q9D8U8 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Snx5Q9D8U8 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Snx5Q9D8U8 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Snx5Q9D8U8 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Snx5Q9D8U8 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Snx5Q9D8U8 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Snx5Q9D8U8 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Snx5Q9D8U8 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Snx5Q9D8U8 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Snx5Q9D8U8 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Snx5Q9D8U8 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Snx5Q9D8U8 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Snx5Q9D8U8 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Snx5Q9D8U8 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Snx5Q9D8U8 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
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Snx5Q9D8U8 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
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