Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8F1

Alkbh4, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh4Q9D8F1 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Alkbh4Q9D8F1 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Alkbh4Q9D8F1 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Alkbh4Q9D8F1 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Alkbh4Q9D8F1 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Alkbh4Q9D8F1 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Alkbh4Q9D8F1 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Alkbh4Q9D8F1 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
Alkbh4Q9D8F1 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
Alkbh4Q9D8F1 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Alkbh4Q9D8F1 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Alkbh4Q9D8F1 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Alkbh4Q9D8F1 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Alkbh4Q9D8F1 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Alkbh4Q9D8F1 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Alkbh4Q9D8F1 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Alkbh4Q9D8F1 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Alkbh4Q9D8F1 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Alkbh4Q9D8F1 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Alkbh4Q9D8F1 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Alkbh4Q9D8F1 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Alkbh4Q9D8F1 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Alkbh4Q9D8F1 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Alkbh4Q9D8F1 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Alkbh4Q9D8F1 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Alkbh4Q9D8F1 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Alkbh4Q9D8F1 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Alkbh4Q9D8F1 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Alkbh4Q9D8F1 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Alkbh4Q9D8F1 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Alkbh4Q9D8F1 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Alkbh4Q9D8F1 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Alkbh4Q9D8F1 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Alkbh4Q9D8F1 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Alkbh4Q9D8F1 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Alkbh4Q9D8F1 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Alkbh4Q9D8F1 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Alkbh4Q9D8F1 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Alkbh4Q9D8F1 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Alkbh4Q9D8F1 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Alkbh4Q9D8F1 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Alkbh4Q9D8F1 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Alkbh4Q9D8F1 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Alkbh4Q9D8F1 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Alkbh4Q9D8F1 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Alkbh4Q9D8F1 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Alkbh4Q9D8F1 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Alkbh4Q9D8F1 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Alkbh4Q9D8F1 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Alkbh4Q9D8F1 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Alkbh4Q9D8F1 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Alkbh4Q9D8F1 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Alkbh4Q9D8F1 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Alkbh4Q9D8F1 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Alkbh4Q9D8F1 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Alkbh4Q9D8F1 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Alkbh4Q9D8F1 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Alkbh4Q9D8F1 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Alkbh4Q9D8F1 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Alkbh4Q9D8F1 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Alkbh4Q9D8F1 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Alkbh4Q9D8F1 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Alkbh4Q9D8F1 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Alkbh4Q9D8F1 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Alkbh4Q9D8F1 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Alkbh4Q9D8F1 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Alkbh4Q9D8F1 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Alkbh4Q9D8F1 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Alkbh4Q9D8F1 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Alkbh4Q9D8F1 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Alkbh4Q9D8F1 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Alkbh4Q9D8F1 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Alkbh4Q9D8F1 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Alkbh4Q9D8F1 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Alkbh4Q9D8F1 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Alkbh4Q9D8F1 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Alkbh4Q9D8F1 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Alkbh4Q9D8F1 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Alkbh4Q9D8F1 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Alkbh4Q9D8F1 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Alkbh4Q9D8F1 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Alkbh4Q9D8F1 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Alkbh4Q9D8F1 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Alkbh4Q9D8F1 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Alkbh4Q9D8F1 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Alkbh4Q9D8F1 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Alkbh4Q9D8F1 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Alkbh4Q9D8F1 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Alkbh4Q9D8F1 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Alkbh4Q9D8F1 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Alkbh4Q9D8F1 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Alkbh4Q9D8F1 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Alkbh4Q9D8F1 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Alkbh4Q9D8F1 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Alkbh4Q9D8F1 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Alkbh4Q9D8F1 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Alkbh4Q9D8F1 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Alkbh4Q9D8F1 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Alkbh4Q9D8F1 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Alkbh4Q9D8F1 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms