Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7Y9

Slx4ip, Protein SLX4IP, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4ipQ9D7Y9 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slx4ipQ9D7Y9 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slx4ipQ9D7Y9 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Slx4ipQ9D7Y9 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slx4ipQ9D7Y9 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slx4ipQ9D7Y9 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slx4ipQ9D7Y9 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slx4ipQ9D7Y9 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Slx4ipQ9D7Y9 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slx4ipQ9D7Y9 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slx4ipQ9D7Y9 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slx4ipQ9D7Y9 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Slx4ipQ9D7Y9 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slx4ipQ9D7Y9 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slx4ipQ9D7Y9 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slx4ipQ9D7Y9 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slx4ipQ9D7Y9 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slx4ipQ9D7Y9 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slx4ipQ9D7Y9 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slx4ipQ9D7Y9 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slx4ipQ9D7Y9 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slx4ipQ9D7Y9 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slx4ipQ9D7Y9 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slx4ipQ9D7Y9 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slx4ipQ9D7Y9 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slx4ipQ9D7Y9 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slx4ipQ9D7Y9 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slx4ipQ9D7Y9 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slx4ipQ9D7Y9 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slx4ipQ9D7Y9 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slx4ipQ9D7Y9 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slx4ipQ9D7Y9 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slx4ipQ9D7Y9 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Slx4ipQ9D7Y9 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slx4ipQ9D7Y9 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slx4ipQ9D7Y9 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slx4ipQ9D7Y9 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slx4ipQ9D7Y9 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Slx4ipQ9D7Y9 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Slx4ipQ9D7Y9 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slx4ipQ9D7Y9 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slx4ipQ9D7Y9 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slx4ipQ9D7Y9 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slx4ipQ9D7Y9 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Slx4ipQ9D7Y9 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slx4ipQ9D7Y9 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slx4ipQ9D7Y9 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Slx4ipQ9D7Y9 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slx4ipQ9D7Y9 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slx4ipQ9D7Y9 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slx4ipQ9D7Y9 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slx4ipQ9D7Y9 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slx4ipQ9D7Y9 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slx4ipQ9D7Y9 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slx4ipQ9D7Y9 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slx4ipQ9D7Y9 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slx4ipQ9D7Y9 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slx4ipQ9D7Y9 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slx4ipQ9D7Y9 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slx4ipQ9D7Y9 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slx4ipQ9D7Y9 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slx4ipQ9D7Y9 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slx4ipQ9D7Y9 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slx4ipQ9D7Y9 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slx4ipQ9D7Y9 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Slx4ipQ9D7Y9 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Slx4ipQ9D7Y9 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Slx4ipQ9D7Y9 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slx4ipQ9D7Y9 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slx4ipQ9D7Y9 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Slx4ipQ9D7Y9 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slx4ipQ9D7Y9 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slx4ipQ9D7Y9 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slx4ipQ9D7Y9 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slx4ipQ9D7Y9 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slx4ipQ9D7Y9 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slx4ipQ9D7Y9 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slx4ipQ9D7Y9 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slx4ipQ9D7Y9 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slx4ipQ9D7Y9 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slx4ipQ9D7Y9 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slx4ipQ9D7Y9 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slx4ipQ9D7Y9 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slx4ipQ9D7Y9 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Slx4ipQ9D7Y9 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slx4ipQ9D7Y9 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slx4ipQ9D7Y9 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slx4ipQ9D7Y9 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slx4ipQ9D7Y9 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slx4ipQ9D7Y9 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slx4ipQ9D7Y9 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slx4ipQ9D7Y9 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slx4ipQ9D7Y9 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Slx4ipQ9D7Y9 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slx4ipQ9D7Y9 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slx4ipQ9D7Y9 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slx4ipQ9D7Y9 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slx4ipQ9D7Y9 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slx4ipQ9D7Y9 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slx4ipQ9D7Y9 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms