Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7T1

Rep15, Rab15 effector protein, mousemouse

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rep15Q9D7T1 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rep15Q9D7T1 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rep15Q9D7T1 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rep15Q9D7T1 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rep15Q9D7T1 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rep15Q9D7T1 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rep15Q9D7T1 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rep15Q9D7T1 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rep15Q9D7T1 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rep15Q9D7T1 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rep15Q9D7T1 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Rep15Q9D7T1 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rep15Q9D7T1 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Rep15Q9D7T1 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rep15Q9D7T1 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rep15Q9D7T1 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rep15Q9D7T1 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rep15Q9D7T1 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rep15Q9D7T1 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rep15Q9D7T1 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rep15Q9D7T1 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rep15Q9D7T1 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rep15Q9D7T1 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rep15Q9D7T1 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rep15Q9D7T1 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rep15Q9D7T1 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rep15Q9D7T1 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rep15Q9D7T1 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rep15Q9D7T1 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rep15Q9D7T1 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rep15Q9D7T1 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rep15Q9D7T1 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rep15Q9D7T1 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rep15Q9D7T1 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rep15Q9D7T1 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rep15Q9D7T1 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rep15Q9D7T1 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rep15Q9D7T1 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rep15Q9D7T1 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rep15Q9D7T1 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rep15Q9D7T1 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rep15Q9D7T1 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Rep15Q9D7T1 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Rep15Q9D7T1 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rep15Q9D7T1 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rep15Q9D7T1 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rep15Q9D7T1 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rep15Q9D7T1 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rep15Q9D7T1 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rep15Q9D7T1 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rep15Q9D7T1 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rep15Q9D7T1 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rep15Q9D7T1 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rep15Q9D7T1 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rep15Q9D7T1 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rep15Q9D7T1 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rep15Q9D7T1 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rep15Q9D7T1 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rep15Q9D7T1 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rep15Q9D7T1 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rep15Q9D7T1 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Rep15Q9D7T1 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rep15Q9D7T1 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rep15Q9D7T1 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rep15Q9D7T1 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rep15Q9D7T1 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rep15Q9D7T1 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rep15Q9D7T1 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rep15Q9D7T1 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rep15Q9D7T1 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rep15Q9D7T1 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rep15Q9D7T1 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rep15Q9D7T1 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rep15Q9D7T1 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rep15Q9D7T1 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rep15Q9D7T1 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rep15Q9D7T1 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rep15Q9D7T1 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rep15Q9D7T1 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rep15Q9D7T1 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rep15Q9D7T1 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rep15Q9D7T1 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rep15Q9D7T1 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rep15Q9D7T1 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rep15Q9D7T1 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rep15Q9D7T1 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rep15Q9D7T1 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rep15Q9D7T1 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rep15Q9D7T1 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rep15Q9D7T1 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
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