Protein–RNA interactions for Protein: Q9D727

Uncharacterized protein C6orf226 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D727 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Q9D727 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Q9D727 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Q9D727 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Q9D727 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Q9D727 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Q9D727 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Q9D727 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Q9D727 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Q9D727 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Q9D727 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Q9D727 Wdcp-201ENSMUST00000053034 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q9D727 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q9D727 Gm10465-201ENSMUST00000223133 3334 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q9D727 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q9D727 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q9D727 Slc6a9-202ENSMUST00000063857 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q9D727 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q9D727 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q9D727 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q9D727 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q9D727 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Q9D727 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q9D727 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Q9D727 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q9D727 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q9D727 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q9D727 Hrc-201ENSMUST00000085351 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q9D727 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q9D727 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q9D727 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q9D727 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q9D727 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q9D727 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q9D727 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Q9D727 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Q9D727 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q9D727 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q9D727 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q9D727 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q9D727 Gal3st4-201ENSMUST00000100530 3162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q9D727 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q9D727 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q9D727 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q9D727 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q9D727 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q9D727 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q9D727 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q9D727 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q9D727 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q9D727 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Q9D727 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q9D727 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q9D727 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q9D727 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q9D727 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q9D727 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q9D727 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Q9D727 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Q9D727 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Q9D727 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Q9D727 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Q9D727 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Q9D727 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Q9D727 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Q9D727 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Q9D727 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Q9D727 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Q9D727 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Q9D727 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Q9D727 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Q9D727 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Q9D727 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Q9D727 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Q9D727 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Q9D727 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Q9D727 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Q9D727 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Q9D727 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Q9D727 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Q9D727 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Q9D727 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Q9D727 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Q9D727 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Q9D727 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Q9D727 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Q9D727 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Q9D727 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Q9D727 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Q9D727 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Q9D727 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Q9D727 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Q9D727 Atl2-201ENSMUST00000068282 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Q9D727 AC129336.2-201ENSMUST00000218053 3086 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Q9D727 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Q9D727 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Q9D727 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Q9D727 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Q9D727 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Q9D727 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms