Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Gm14716-201ENSMUST00000120138 718 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Nop56Q9D6Z1 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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