Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J3

Ccdc94, Coiled-coil domain-containing protein 94, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc94Q9D6J3 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc94Q9D6J3 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc94Q9D6J3 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc94Q9D6J3 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc94Q9D6J3 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc94Q9D6J3 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc94Q9D6J3 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc94Q9D6J3 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc94Q9D6J3 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc94Q9D6J3 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc94Q9D6J3 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc94Q9D6J3 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc94Q9D6J3 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc94Q9D6J3 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc94Q9D6J3 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc94Q9D6J3 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc94Q9D6J3 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc94Q9D6J3 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc94Q9D6J3 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc94Q9D6J3 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc94Q9D6J3 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc94Q9D6J3 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc94Q9D6J3 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc94Q9D6J3 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc94Q9D6J3 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc94Q9D6J3 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc94Q9D6J3 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc94Q9D6J3 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc94Q9D6J3 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc94Q9D6J3 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc94Q9D6J3 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc94Q9D6J3 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc94Q9D6J3 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc94Q9D6J3 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc94Q9D6J3 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc94Q9D6J3 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc94Q9D6J3 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc94Q9D6J3 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc94Q9D6J3 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc94Q9D6J3 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc94Q9D6J3 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc94Q9D6J3 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc94Q9D6J3 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc94Q9D6J3 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc94Q9D6J3 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc94Q9D6J3 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc94Q9D6J3 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc94Q9D6J3 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc94Q9D6J3 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc94Q9D6J3 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc94Q9D6J3 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc94Q9D6J3 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc94Q9D6J3 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc94Q9D6J3 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc94Q9D6J3 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc94Q9D6J3 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc94Q9D6J3 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc94Q9D6J3 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc94Q9D6J3 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc94Q9D6J3 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc94Q9D6J3 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc94Q9D6J3 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc94Q9D6J3 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc94Q9D6J3 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc94Q9D6J3 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc94Q9D6J3 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc94Q9D6J3 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc94Q9D6J3 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc94Q9D6J3 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc94Q9D6J3 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc94Q9D6J3 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc94Q9D6J3 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc94Q9D6J3 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc94Q9D6J3 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc94Q9D6J3 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc94Q9D6J3 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc94Q9D6J3 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc94Q9D6J3 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc94Q9D6J3 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc94Q9D6J3 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc94Q9D6J3 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc94Q9D6J3 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc94Q9D6J3 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc94Q9D6J3 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc94Q9D6J3 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc94Q9D6J3 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc94Q9D6J3 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc94Q9D6J3 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc94Q9D6J3 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc94Q9D6J3 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc94Q9D6J3 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc94Q9D6J3 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc94Q9D6J3 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc94Q9D6J3 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc94Q9D6J3 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc94Q9D6J3 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc94Q9D6J3 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc94Q9D6J3 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc94Q9D6J3 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc94Q9D6J3 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms