Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4W2

Uncharacterized protein C11orf65 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D4W2 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9D4W2 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9D4W2 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9D4W2 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9D4W2 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9D4W2 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9D4W2 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9D4W2 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9D4W2 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9D4W2 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9D4W2 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9D4W2 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9D4W2 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9D4W2 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9D4W2 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9D4W2 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9D4W2 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9D4W2 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9D4W2 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9D4W2 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9D4W2 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9D4W2 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9D4W2 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9D4W2 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9D4W2 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9D4W2 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Q9D4W2 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Q9D4W2 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9D4W2 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9D4W2 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9D4W2 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9D4W2 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9D4W2 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9D4W2 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9D4W2 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9D4W2 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9D4W2 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9D4W2 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9D4W2 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9D4W2 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9D4W2 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9D4W2 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9D4W2 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9D4W2 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9D4W2 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9D4W2 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9D4W2 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9D4W2 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9D4W2 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9D4W2 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9D4W2 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9D4W2 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9D4W2 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9D4W2 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9D4W2 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9D4W2 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9D4W2 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9D4W2 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9D4W2 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9D4W2 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9D4W2 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9D4W2 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9D4W2 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9D4W2 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9D4W2 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9D4W2 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9D4W2 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9D4W2 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9D4W2 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9D4W2 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9D4W2 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9D4W2 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9D4W2 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9D4W2 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9D4W2 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9D4W2 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9D4W2 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9D4W2 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9D4W2 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9D4W2 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9D4W2 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9D4W2 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q9D4W2 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q9D4W2 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q9D4W2 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q9D4W2 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q9D4W2 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q9D4W2 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q9D4W2 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q9D4W2 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q9D4W2 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q9D4W2 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q9D4W2 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q9D4W2 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q9D4W2 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q9D4W2 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q9D4W2 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q9D4W2 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q9D4W2 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Q9D4W2 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms