Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4F8

Tubgcp4, Gamma-tubulin complex component 4, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp4Q9D4F8 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Tubgcp4Q9D4F8 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tubgcp4Q9D4F8 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Tubgcp4Q9D4F8 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Tubgcp4Q9D4F8 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tubgcp4Q9D4F8 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Tubgcp4Q9D4F8 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Tubgcp4Q9D4F8 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Tubgcp4Q9D4F8 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tubgcp4Q9D4F8 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tubgcp4Q9D4F8 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Tubgcp4Q9D4F8 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tubgcp4Q9D4F8 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tubgcp4Q9D4F8 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tubgcp4Q9D4F8 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tubgcp4Q9D4F8 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tubgcp4Q9D4F8 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tubgcp4Q9D4F8 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tubgcp4Q9D4F8 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tubgcp4Q9D4F8 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tubgcp4Q9D4F8 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tubgcp4Q9D4F8 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tubgcp4Q9D4F8 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tubgcp4Q9D4F8 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tubgcp4Q9D4F8 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Tubgcp4Q9D4F8 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Tubgcp4Q9D4F8 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Tubgcp4Q9D4F8 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tubgcp4Q9D4F8 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tubgcp4Q9D4F8 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tubgcp4Q9D4F8 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tubgcp4Q9D4F8 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tubgcp4Q9D4F8 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tubgcp4Q9D4F8 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tubgcp4Q9D4F8 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tubgcp4Q9D4F8 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tubgcp4Q9D4F8 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tubgcp4Q9D4F8 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tubgcp4Q9D4F8 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tubgcp4Q9D4F8 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tubgcp4Q9D4F8 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tubgcp4Q9D4F8 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tubgcp4Q9D4F8 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tubgcp4Q9D4F8 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Tubgcp4Q9D4F8 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tubgcp4Q9D4F8 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tubgcp4Q9D4F8 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tubgcp4Q9D4F8 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Tubgcp4Q9D4F8 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tubgcp4Q9D4F8 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Tubgcp4Q9D4F8 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Tubgcp4Q9D4F8 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tubgcp4Q9D4F8 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tubgcp4Q9D4F8 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Tubgcp4Q9D4F8 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Tubgcp4Q9D4F8 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Tubgcp4Q9D4F8 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tubgcp4Q9D4F8 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tubgcp4Q9D4F8 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tubgcp4Q9D4F8 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Tubgcp4Q9D4F8 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tubgcp4Q9D4F8 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tubgcp4Q9D4F8 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tubgcp4Q9D4F8 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tubgcp4Q9D4F8 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Tubgcp4Q9D4F8 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tubgcp4Q9D4F8 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tubgcp4Q9D4F8 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tubgcp4Q9D4F8 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tubgcp4Q9D4F8 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Tubgcp4Q9D4F8 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tubgcp4Q9D4F8 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tubgcp4Q9D4F8 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tubgcp4Q9D4F8 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tubgcp4Q9D4F8 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tubgcp4Q9D4F8 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tubgcp4Q9D4F8 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tubgcp4Q9D4F8 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tubgcp4Q9D4F8 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tubgcp4Q9D4F8 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tubgcp4Q9D4F8 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tubgcp4Q9D4F8 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tubgcp4Q9D4F8 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tubgcp4Q9D4F8 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tubgcp4Q9D4F8 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Tubgcp4Q9D4F8 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tubgcp4Q9D4F8 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Tubgcp4Q9D4F8 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tubgcp4Q9D4F8 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tubgcp4Q9D4F8 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tubgcp4Q9D4F8 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tubgcp4Q9D4F8 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tubgcp4Q9D4F8 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Tubgcp4Q9D4F8 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tubgcp4Q9D4F8 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tubgcp4Q9D4F8 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tubgcp4Q9D4F8 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tubgcp4Q9D4F8 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tubgcp4Q9D4F8 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tubgcp4Q9D4F8 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.1 ms