Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
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