Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1C1

Ube2c, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 C, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2cQ9D1C1 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ube2cQ9D1C1 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ube2cQ9D1C1 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ube2cQ9D1C1 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ube2cQ9D1C1 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ube2cQ9D1C1 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ube2cQ9D1C1 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ube2cQ9D1C1 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ube2cQ9D1C1 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ube2cQ9D1C1 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ube2cQ9D1C1 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ube2cQ9D1C1 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Ube2cQ9D1C1 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Ube2cQ9D1C1 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Ube2cQ9D1C1 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Ube2cQ9D1C1 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Ube2cQ9D1C1 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Ube2cQ9D1C1 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Ube2cQ9D1C1 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Ube2cQ9D1C1 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Ube2cQ9D1C1 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Ube2cQ9D1C1 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Ube2cQ9D1C1 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Ube2cQ9D1C1 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ube2cQ9D1C1 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ube2cQ9D1C1 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ube2cQ9D1C1 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ube2cQ9D1C1 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ube2cQ9D1C1 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ube2cQ9D1C1 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ube2cQ9D1C1 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ube2cQ9D1C1 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ube2cQ9D1C1 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ube2cQ9D1C1 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ube2cQ9D1C1 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ube2cQ9D1C1 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ube2cQ9D1C1 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ube2cQ9D1C1 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ube2cQ9D1C1 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ube2cQ9D1C1 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Ube2cQ9D1C1 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Ube2cQ9D1C1 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Ube2cQ9D1C1 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Ube2cQ9D1C1 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ube2cQ9D1C1 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ube2cQ9D1C1 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ube2cQ9D1C1 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ube2cQ9D1C1 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ube2cQ9D1C1 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ube2cQ9D1C1 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ube2cQ9D1C1 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ube2cQ9D1C1 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ube2cQ9D1C1 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ube2cQ9D1C1 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ube2cQ9D1C1 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ube2cQ9D1C1 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ube2cQ9D1C1 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ube2cQ9D1C1 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ube2cQ9D1C1 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ube2cQ9D1C1 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Ube2cQ9D1C1 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ube2cQ9D1C1 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ube2cQ9D1C1 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ube2cQ9D1C1 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ube2cQ9D1C1 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ube2cQ9D1C1 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ube2cQ9D1C1 Olfr239-202ENSMUST00000213731 3690 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ube2cQ9D1C1 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Ube2cQ9D1C1 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ube2cQ9D1C1 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ube2cQ9D1C1 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ube2cQ9D1C1 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ube2cQ9D1C1 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ube2cQ9D1C1 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ube2cQ9D1C1 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ube2cQ9D1C1 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ube2cQ9D1C1 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ube2cQ9D1C1 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ube2cQ9D1C1 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ube2cQ9D1C1 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ube2cQ9D1C1 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ube2cQ9D1C1 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ube2cQ9D1C1 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ube2cQ9D1C1 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ube2cQ9D1C1 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Ube2cQ9D1C1 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ube2cQ9D1C1 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ube2cQ9D1C1 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Ube2cQ9D1C1 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Ube2cQ9D1C1 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Ube2cQ9D1C1 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Ube2cQ9D1C1 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Ube2cQ9D1C1 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ube2cQ9D1C1 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ube2cQ9D1C1 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ube2cQ9D1C1 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ube2cQ9D1C1 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Ube2cQ9D1C1 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Ube2cQ9D1C1 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ube2cQ9D1C1 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.7 ms