Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

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Length 257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mrpl28Q9D1B9 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mrpl28Q9D1B9 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mrpl28Q9D1B9 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mrpl28Q9D1B9 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mrpl28Q9D1B9 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mrpl28Q9D1B9 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mrpl28Q9D1B9 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mrpl28Q9D1B9 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mrpl28Q9D1B9 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mrpl28Q9D1B9 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mrpl28Q9D1B9 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Mrpl28Q9D1B9 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Mrpl28Q9D1B9 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Mrpl28Q9D1B9 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Mrpl28Q9D1B9 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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Mrpl28Q9D1B9 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Mrpl28Q9D1B9 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Mrpl28Q9D1B9 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Mrpl28Q9D1B9 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Mrpl28Q9D1B9 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Mrpl28Q9D1B9 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Mrpl28Q9D1B9 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Mrpl28Q9D1B9 AC107453.4-201ENSMUST00000227068 1817 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Mrpl28Q9D1B9 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Mrpl28Q9D1B9 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Mrpl28Q9D1B9 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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Mrpl28Q9D1B9 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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Mrpl28Q9D1B9 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Mrpl28Q9D1B9 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Mrpl28Q9D1B9 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Mrpl28Q9D1B9 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Mrpl28Q9D1B9 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Mrpl28Q9D1B9 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
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Mrpl28Q9D1B9 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Mrpl28Q9D1B9 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Mrpl28Q9D1B9 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Mrpl28Q9D1B9 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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Mrpl28Q9D1B9 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Mrpl28Q9D1B9 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Mrpl28Q9D1B9 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Mrpl28Q9D1B9 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Mrpl28Q9D1B9 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Mrpl28Q9D1B9 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Mrpl28Q9D1B9 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Mrpl28Q9D1B9 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Mrpl28Q9D1B9 Bod1l-201ENSMUST00000050556 10540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Mrpl28Q9D1B9 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Mrpl28Q9D1B9 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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Mrpl28Q9D1B9 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Mrpl28Q9D1B9 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Mrpl28Q9D1B9 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Mrpl28Q9D1B9 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Mrpl28Q9D1B9 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Mrpl28Q9D1B9 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Mrpl28Q9D1B9 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl28Q9D1B9 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Mrpl28Q9D1B9 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Mrpl28Q9D1B9 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl28Q9D1B9 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl28Q9D1B9 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl28Q9D1B9 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl28Q9D1B9 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl28Q9D1B9 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl28Q9D1B9 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl28Q9D1B9 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl28Q9D1B9 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl28Q9D1B9 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl28Q9D1B9 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl28Q9D1B9 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl28Q9D1B9 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl28Q9D1B9 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl28Q9D1B9 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl28Q9D1B9 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl28Q9D1B9 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl28Q9D1B9 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl28Q9D1B9 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl28Q9D1B9 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl28Q9D1B9 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl28Q9D1B9 Ddah1-202ENSMUST00000120310 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl28Q9D1B9 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
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