Protein–RNA interactions for Protein: Q9D114

Hddc3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc3Q9D114 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 423.2 ms