Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0N8

Tmem88, Transmembrane protein 88, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem88Q9D0N8 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmem88Q9D0N8 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmem88Q9D0N8 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmem88Q9D0N8 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmem88Q9D0N8 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem88Q9D0N8 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem88Q9D0N8 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem88Q9D0N8 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem88Q9D0N8 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem88Q9D0N8 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem88Q9D0N8 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem88Q9D0N8 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem88Q9D0N8 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem88Q9D0N8 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem88Q9D0N8 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem88Q9D0N8 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem88Q9D0N8 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem88Q9D0N8 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem88Q9D0N8 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
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Tmem88Q9D0N8 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem88Q9D0N8 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem88Q9D0N8 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem88Q9D0N8 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem88Q9D0N8 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem88Q9D0N8 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem88Q9D0N8 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem88Q9D0N8 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem88Q9D0N8 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem88Q9D0N8 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem88Q9D0N8 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
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Tmem88Q9D0N8 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem88Q9D0N8 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem88Q9D0N8 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem88Q9D0N8 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem88Q9D0N8 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem88Q9D0N8 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem88Q9D0N8 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem88Q9D0N8 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem88Q9D0N8 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem88Q9D0N8 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem88Q9D0N8 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem88Q9D0N8 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
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Tmem88Q9D0N8 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem88Q9D0N8 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem88Q9D0N8 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem88Q9D0N8 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem88Q9D0N8 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem88Q9D0N8 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
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Tmem88Q9D0N8 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem88Q9D0N8 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem88Q9D0N8 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem88Q9D0N8 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem88Q9D0N8 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
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Tmem88Q9D0N8 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
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Tmem88Q9D0N8 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
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Tmem88Q9D0N8 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem88Q9D0N8 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem88Q9D0N8 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem88Q9D0N8 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem88Q9D0N8 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem88Q9D0N8 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem88Q9D0N8 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem88Q9D0N8 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem88Q9D0N8 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem88Q9D0N8 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem88Q9D0N8 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem88Q9D0N8 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem88Q9D0N8 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem88Q9D0N8 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem88Q9D0N8 Plekhg4-206ENSMUST00000214056 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem88Q9D0N8 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmem88Q9D0N8 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmem88Q9D0N8 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmem88Q9D0N8 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmem88Q9D0N8 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmem88Q9D0N8 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmem88Q9D0N8 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmem88Q9D0N8 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmem88Q9D0N8 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmem88Q9D0N8 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmem88Q9D0N8 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.2 ms