Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY57

Chtop, Chromatin target of PRMT1 protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChtopQ9CY57 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Ilf3-202ENSMUST00000115414 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 4930488L21Rik-202ENSMUST00000212638 3164 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
ChtopQ9CY57 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
ChtopQ9CY57 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
ChtopQ9CY57 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
ChtopQ9CY57 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
ChtopQ9CY57 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
ChtopQ9CY57 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
ChtopQ9CY57 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
ChtopQ9CY57 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
ChtopQ9CY57 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
ChtopQ9CY57 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
ChtopQ9CY57 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
ChtopQ9CY57 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
ChtopQ9CY57 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
ChtopQ9CY57 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
ChtopQ9CY57 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
ChtopQ9CY57 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
ChtopQ9CY57 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
ChtopQ9CY57 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
ChtopQ9CY57 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
ChtopQ9CY57 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
ChtopQ9CY57 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
ChtopQ9CY57 Arfgap3-202ENSMUST00000226124 2461 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
ChtopQ9CY57 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
ChtopQ9CY57 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
ChtopQ9CY57 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
ChtopQ9CY57 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
ChtopQ9CY57 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
ChtopQ9CY57 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
ChtopQ9CY57 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
ChtopQ9CY57 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
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