Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY25

Mis12, Protein MIS12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mis12Q9CY25 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Mis12Q9CY25 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Mis12Q9CY25 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Mis12Q9CY25 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Mis12Q9CY25 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mis12Q9CY25 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mis12Q9CY25 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mis12Q9CY25 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mis12Q9CY25 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mis12Q9CY25 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mis12Q9CY25 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mis12Q9CY25 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Mis12Q9CY25 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mis12Q9CY25 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mis12Q9CY25 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mis12Q9CY25 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mis12Q9CY25 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mis12Q9CY25 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mis12Q9CY25 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mis12Q9CY25 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mis12Q9CY25 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mis12Q9CY25 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mis12Q9CY25 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mis12Q9CY25 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mis12Q9CY25 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mis12Q9CY25 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Mis12Q9CY25 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mis12Q9CY25 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mis12Q9CY25 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mis12Q9CY25 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mis12Q9CY25 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mis12Q9CY25 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mis12Q9CY25 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mis12Q9CY25 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mis12Q9CY25 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mis12Q9CY25 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mis12Q9CY25 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mis12Q9CY25 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mis12Q9CY25 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mis12Q9CY25 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Mis12Q9CY25 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mis12Q9CY25 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mis12Q9CY25 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mis12Q9CY25 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mis12Q9CY25 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mis12Q9CY25 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mis12Q9CY25 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mis12Q9CY25 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mis12Q9CY25 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Mis12Q9CY25 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Mis12Q9CY25 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mis12Q9CY25 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mis12Q9CY25 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mis12Q9CY25 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mis12Q9CY25 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mis12Q9CY25 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mis12Q9CY25 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mis12Q9CY25 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mis12Q9CY25 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mis12Q9CY25 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mis12Q9CY25 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mis12Q9CY25 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mis12Q9CY25 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mis12Q9CY25 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mis12Q9CY25 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mis12Q9CY25 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mis12Q9CY25 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mis12Q9CY25 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mis12Q9CY25 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mis12Q9CY25 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mis12Q9CY25 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mis12Q9CY25 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Mis12Q9CY25 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mis12Q9CY25 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mis12Q9CY25 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mis12Q9CY25 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mis12Q9CY25 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mis12Q9CY25 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mis12Q9CY25 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mis12Q9CY25 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Mis12Q9CY25 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mis12Q9CY25 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mis12Q9CY25 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mis12Q9CY25 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mis12Q9CY25 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mis12Q9CY25 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mis12Q9CY25 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms