Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTH6

Fcf1, rRNA-processing protein FCF1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcf1Q9CTH6 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Gm38018-201ENSMUST00000195651 540 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 AC154616.1-201ENSMUST00000226995 804 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Ndufc1-201ENSMUST00000038108 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Gm12718-202ENSMUST00000156144 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Gm22119-201ENSMUST00000175594 99 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Fcf1Q9CTH6 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.3 ms