Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSN1

Snw1, SNW domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snw1Q9CSN1 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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