Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim8Q9CQQ0 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim8Q9CQQ0 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim8Q9CQQ0 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim8Q9CQQ0 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim8Q9CQQ0 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim8Q9CQQ0 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim8Q9CQQ0 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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Smim8Q9CQQ0 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim8Q9CQQ0 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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Smim8Q9CQQ0 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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Smim8Q9CQQ0 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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Smim8Q9CQQ0 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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Smim8Q9CQQ0 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim8Q9CQQ0 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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Smim8Q9CQQ0 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim8Q9CQQ0 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim8Q9CQQ0 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim8Q9CQQ0 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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Smim8Q9CQQ0 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim8Q9CQQ0 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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Smim8Q9CQQ0 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smim8Q9CQQ0 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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Smim8Q9CQQ0 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smim8Q9CQQ0 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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Smim8Q9CQQ0 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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Smim8Q9CQQ0 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smim8Q9CQQ0 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smim8Q9CQQ0 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smim8Q9CQQ0 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smim8Q9CQQ0 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smim8Q9CQQ0 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smim8Q9CQQ0 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smim8Q9CQQ0 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smim8Q9CQQ0 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smim8Q9CQQ0 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smim8Q9CQQ0 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim8Q9CQQ0 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim8Q9CQQ0 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim8Q9CQQ0 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim8Q9CQQ0 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim8Q9CQQ0 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim8Q9CQQ0 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim8Q9CQQ0 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
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