Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM0

Nicn1, Nicolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nicn1Q9CQM0 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
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Nicn1Q9CQM0 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
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Nicn1Q9CQM0 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Nicn1Q9CQM0 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
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Nicn1Q9CQM0 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
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Nicn1Q9CQM0 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms