Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQH0

Pdzk1ip1, PDZK1-interacting protein 1, mousemouse

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Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzk1ip1Q9CQH0 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms