Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ71

Rpa3, Replication protein A 14 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpa3Q9CQ71 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rpa3Q9CQ71 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rpa3Q9CQ71 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rpa3Q9CQ71 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rpa3Q9CQ71 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rpa3Q9CQ71 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rpa3Q9CQ71 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rpa3Q9CQ71 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rpa3Q9CQ71 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rpa3Q9CQ71 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpa3Q9CQ71 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpa3Q9CQ71 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpa3Q9CQ71 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpa3Q9CQ71 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpa3Q9CQ71 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpa3Q9CQ71 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpa3Q9CQ71 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpa3Q9CQ71 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpa3Q9CQ71 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpa3Q9CQ71 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpa3Q9CQ71 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpa3Q9CQ71 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpa3Q9CQ71 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpa3Q9CQ71 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpa3Q9CQ71 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpa3Q9CQ71 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpa3Q9CQ71 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpa3Q9CQ71 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpa3Q9CQ71 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpa3Q9CQ71 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpa3Q9CQ71 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpa3Q9CQ71 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpa3Q9CQ71 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpa3Q9CQ71 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpa3Q9CQ71 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpa3Q9CQ71 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpa3Q9CQ71 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpa3Q9CQ71 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpa3Q9CQ71 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpa3Q9CQ71 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpa3Q9CQ71 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpa3Q9CQ71 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpa3Q9CQ71 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpa3Q9CQ71 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpa3Q9CQ71 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpa3Q9CQ71 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpa3Q9CQ71 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpa3Q9CQ71 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpa3Q9CQ71 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpa3Q9CQ71 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpa3Q9CQ71 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpa3Q9CQ71 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpa3Q9CQ71 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpa3Q9CQ71 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpa3Q9CQ71 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpa3Q9CQ71 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpa3Q9CQ71 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpa3Q9CQ71 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpa3Q9CQ71 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpa3Q9CQ71 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpa3Q9CQ71 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpa3Q9CQ71 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpa3Q9CQ71 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpa3Q9CQ71 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpa3Q9CQ71 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpa3Q9CQ71 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpa3Q9CQ71 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpa3Q9CQ71 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpa3Q9CQ71 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpa3Q9CQ71 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpa3Q9CQ71 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpa3Q9CQ71 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpa3Q9CQ71 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpa3Q9CQ71 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpa3Q9CQ71 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpa3Q9CQ71 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpa3Q9CQ71 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpa3Q9CQ71 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpa3Q9CQ71 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpa3Q9CQ71 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpa3Q9CQ71 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpa3Q9CQ71 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpa3Q9CQ71 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpa3Q9CQ71 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpa3Q9CQ71 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpa3Q9CQ71 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpa3Q9CQ71 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpa3Q9CQ71 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpa3Q9CQ71 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpa3Q9CQ71 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpa3Q9CQ71 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpa3Q9CQ71 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpa3Q9CQ71 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpa3Q9CQ71 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpa3Q9CQ71 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpa3Q9CQ71 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpa3Q9CQ71 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpa3Q9CQ71 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpa3Q9CQ71 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpa3Q9CQ71 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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