Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Chmp3Q9CQ10 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Chmp3Q9CQ10 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Chmp3Q9CQ10 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Chmp3Q9CQ10 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chmp3Q9CQ10 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chmp3Q9CQ10 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chmp3Q9CQ10 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chmp3Q9CQ10 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Chmp3Q9CQ10 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chmp3Q9CQ10 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chmp3Q9CQ10 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chmp3Q9CQ10 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chmp3Q9CQ10 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chmp3Q9CQ10 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chmp3Q9CQ10 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chmp3Q9CQ10 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chmp3Q9CQ10 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chmp3Q9CQ10 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chmp3Q9CQ10 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Chmp3Q9CQ10 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Chmp3Q9CQ10 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chmp3Q9CQ10 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Chmp3Q9CQ10 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chmp3Q9CQ10 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chmp3Q9CQ10 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chmp3Q9CQ10 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chmp3Q9CQ10 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chmp3Q9CQ10 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chmp3Q9CQ10 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chmp3Q9CQ10 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chmp3Q9CQ10 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chmp3Q9CQ10 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chmp3Q9CQ10 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chmp3Q9CQ10 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chmp3Q9CQ10 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chmp3Q9CQ10 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Chmp3Q9CQ10 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Chmp3Q9CQ10 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chmp3Q9CQ10 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chmp3Q9CQ10 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
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Chmp3Q9CQ10 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Chmp3Q9CQ10 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chmp3Q9CQ10 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Chmp3Q9CQ10 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chmp3Q9CQ10 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chmp3Q9CQ10 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chmp3Q9CQ10 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chmp3Q9CQ10 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Chmp3Q9CQ10 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Chmp3Q9CQ10 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Chmp3Q9CQ10 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chmp3Q9CQ10 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chmp3Q9CQ10 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chmp3Q9CQ10 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chmp3Q9CQ10 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chmp3Q9CQ10 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Chmp3Q9CQ10 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Chmp3Q9CQ10 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chmp3Q9CQ10 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chmp3Q9CQ10 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chmp3Q9CQ10 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chmp3Q9CQ10 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Chmp3Q9CQ10 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chmp3Q9CQ10 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chmp3Q9CQ10 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chmp3Q9CQ10 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Chmp3Q9CQ10 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chmp3Q9CQ10 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chmp3Q9CQ10 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chmp3Q9CQ10 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chmp3Q9CQ10 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp3Q9CQ10 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp3Q9CQ10 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp3Q9CQ10 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp3Q9CQ10 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp3Q9CQ10 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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