Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Usp16Q99LG0 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Usp16Q99LG0 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Usp16Q99LG0 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Usp16Q99LG0 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp16Q99LG0 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp16Q99LG0 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp16Q99LG0 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp16Q99LG0 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp16Q99LG0 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp16Q99LG0 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp16Q99LG0 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp16Q99LG0 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp16Q99LG0 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp16Q99LG0 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp16Q99LG0 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp16Q99LG0 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp16Q99LG0 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp16Q99LG0 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp16Q99LG0 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp16Q99LG0 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp16Q99LG0 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp16Q99LG0 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp16Q99LG0 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp16Q99LG0 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp16Q99LG0 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp16Q99LG0 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp16Q99LG0 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp16Q99LG0 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp16Q99LG0 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp16Q99LG0 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp16Q99LG0 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp16Q99LG0 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp16Q99LG0 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp16Q99LG0 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp16Q99LG0 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp16Q99LG0 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp16Q99LG0 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp16Q99LG0 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp16Q99LG0 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp16Q99LG0 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp16Q99LG0 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp16Q99LG0 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp16Q99LG0 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp16Q99LG0 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp16Q99LG0 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp16Q99LG0 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp16Q99LG0 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp16Q99LG0 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp16Q99LG0 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp16Q99LG0 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp16Q99LG0 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp16Q99LG0 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp16Q99LG0 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp16Q99LG0 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp16Q99LG0 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp16Q99LG0 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp16Q99LG0 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp16Q99LG0 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp16Q99LG0 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp16Q99LG0 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp16Q99LG0 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp16Q99LG0 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp16Q99LG0 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp16Q99LG0 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp16Q99LG0 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp16Q99LG0 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp16Q99LG0 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp16Q99LG0 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp16Q99LG0 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp16Q99LG0 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp16Q99LG0 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp16Q99LG0 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp16Q99LG0 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp16Q99LG0 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp16Q99LG0 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp16Q99LG0 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp16Q99LG0 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp16Q99LG0 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp16Q99LG0 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp16Q99LG0 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp16Q99LG0 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp16Q99LG0 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp16Q99LG0 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp16Q99LG0 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp16Q99LG0 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp16Q99LG0 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp16Q99LG0 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp16Q99LG0 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp16Q99LG0 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp16Q99LG0 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp16Q99LG0 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp16Q99LG0 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp16Q99LG0 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp16Q99LG0 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp16Q99LG0 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp16Q99LG0 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp16Q99LG0 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp16Q99LG0 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp16Q99LG0 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms