Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR3

Lactb2, Endoribonuclease LACTB2, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lactb2Q99KR3 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lactb2Q99KR3 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lactb2Q99KR3 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lactb2Q99KR3 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lactb2Q99KR3 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lactb2Q99KR3 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lactb2Q99KR3 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Lactb2Q99KR3 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lactb2Q99KR3 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lactb2Q99KR3 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lactb2Q99KR3 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lactb2Q99KR3 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lactb2Q99KR3 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lactb2Q99KR3 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lactb2Q99KR3 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lactb2Q99KR3 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lactb2Q99KR3 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Lactb2Q99KR3 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Lactb2Q99KR3 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Lactb2Q99KR3 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lactb2Q99KR3 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lactb2Q99KR3 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Lactb2Q99KR3 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lactb2Q99KR3 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lactb2Q99KR3 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Lactb2Q99KR3 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lactb2Q99KR3 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lactb2Q99KR3 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lactb2Q99KR3 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lactb2Q99KR3 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lactb2Q99KR3 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lactb2Q99KR3 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lactb2Q99KR3 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lactb2Q99KR3 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lactb2Q99KR3 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lactb2Q99KR3 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lactb2Q99KR3 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lactb2Q99KR3 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Lactb2Q99KR3 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lactb2Q99KR3 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lactb2Q99KR3 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lactb2Q99KR3 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lactb2Q99KR3 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lactb2Q99KR3 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lactb2Q99KR3 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Lactb2Q99KR3 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lactb2Q99KR3 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lactb2Q99KR3 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lactb2Q99KR3 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lactb2Q99KR3 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lactb2Q99KR3 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lactb2Q99KR3 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lactb2Q99KR3 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lactb2Q99KR3 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lactb2Q99KR3 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lactb2Q99KR3 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lactb2Q99KR3 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lactb2Q99KR3 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lactb2Q99KR3 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Lactb2Q99KR3 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lactb2Q99KR3 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lactb2Q99KR3 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lactb2Q99KR3 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Lactb2Q99KR3 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Lactb2Q99KR3 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Lactb2Q99KR3 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lactb2Q99KR3 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Lactb2Q99KR3 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Lactb2Q99KR3 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Lactb2Q99KR3 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lactb2Q99KR3 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lactb2Q99KR3 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lactb2Q99KR3 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lactb2Q99KR3 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lactb2Q99KR3 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lactb2Q99KR3 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lactb2Q99KR3 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lactb2Q99KR3 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lactb2Q99KR3 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lactb2Q99KR3 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lactb2Q99KR3 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Lactb2Q99KR3 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Lactb2Q99KR3 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Lactb2Q99KR3 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Lactb2Q99KR3 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Lactb2Q99KR3 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Lactb2Q99KR3 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Lactb2Q99KR3 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Lactb2Q99KR3 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Lactb2Q99KR3 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Lactb2Q99KR3 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Lactb2Q99KR3 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Lactb2Q99KR3 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Lactb2Q99KR3 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Lactb2Q99KR3 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Lactb2Q99KR3 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Lactb2Q99KR3 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Lactb2Q99KR3 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Lactb2Q99KR3 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Lactb2Q99KR3 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms