Protein–RNA interactions for Protein: Q99K46

Usp11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp11Q99K46 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp11Q99K46 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp11Q99K46 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp11Q99K46 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp11Q99K46 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp11Q99K46 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp11Q99K46 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp11Q99K46 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp11Q99K46 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp11Q99K46 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp11Q99K46 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp11Q99K46 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp11Q99K46 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp11Q99K46 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp11Q99K46 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp11Q99K46 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp11Q99K46 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp11Q99K46 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp11Q99K46 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp11Q99K46 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp11Q99K46 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp11Q99K46 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Usp11Q99K46 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Usp11Q99K46 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Usp11Q99K46 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Usp11Q99K46 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Usp11Q99K46 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Usp11Q99K46 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Usp11Q99K46 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp11Q99K46 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp11Q99K46 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp11Q99K46 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp11Q99K46 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp11Q99K46 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp11Q99K46 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp11Q99K46 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp11Q99K46 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp11Q99K46 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp11Q99K46 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp11Q99K46 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp11Q99K46 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp11Q99K46 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp11Q99K46 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp11Q99K46 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp11Q99K46 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp11Q99K46 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp11Q99K46 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp11Q99K46 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp11Q99K46 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp11Q99K46 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp11Q99K46 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp11Q99K46 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp11Q99K46 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp11Q99K46 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp11Q99K46 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp11Q99K46 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp11Q99K46 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp11Q99K46 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp11Q99K46 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp11Q99K46 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp11Q99K46 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp11Q99K46 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp11Q99K46 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp11Q99K46 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp11Q99K46 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp11Q99K46 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp11Q99K46 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp11Q99K46 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp11Q99K46 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp11Q99K46 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp11Q99K46 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp11Q99K46 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp11Q99K46 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp11Q99K46 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp11Q99K46 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp11Q99K46 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp11Q99K46 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp11Q99K46 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp11Q99K46 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp11Q99K46 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp11Q99K46 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp11Q99K46 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp11Q99K46 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp11Q99K46 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp11Q99K46 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp11Q99K46 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp11Q99K46 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp11Q99K46 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp11Q99K46 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp11Q99K46 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp11Q99K46 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp11Q99K46 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp11Q99K46 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp11Q99K46 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp11Q99K46 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp11Q99K46 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp11Q99K46 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp11Q99K46 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp11Q99K46 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp11Q99K46 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms