Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY6

Higd1b, HIG1 domain family member 1B, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1bQ99JY6 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Higd1bQ99JY6 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Higd1bQ99JY6 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Higd1bQ99JY6 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Higd1bQ99JY6 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Higd1bQ99JY6 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Higd1bQ99JY6 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Higd1bQ99JY6 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Higd1bQ99JY6 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Higd1bQ99JY6 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Higd1bQ99JY6 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Higd1bQ99JY6 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Higd1bQ99JY6 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Higd1bQ99JY6 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Higd1bQ99JY6 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Higd1bQ99JY6 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Higd1bQ99JY6 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Higd1bQ99JY6 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Higd1bQ99JY6 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Higd1bQ99JY6 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Higd1bQ99JY6 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Higd1bQ99JY6 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Higd1bQ99JY6 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Higd1bQ99JY6 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Higd1bQ99JY6 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Higd1bQ99JY6 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Higd1bQ99JY6 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Higd1bQ99JY6 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Higd1bQ99JY6 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Higd1bQ99JY6 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Higd1bQ99JY6 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Higd1bQ99JY6 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Higd1bQ99JY6 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Higd1bQ99JY6 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Higd1bQ99JY6 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Higd1bQ99JY6 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Higd1bQ99JY6 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Higd1bQ99JY6 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Higd1bQ99JY6 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Higd1bQ99JY6 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Higd1bQ99JY6 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Higd1bQ99JY6 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Higd1bQ99JY6 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Higd1bQ99JY6 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Higd1bQ99JY6 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Higd1bQ99JY6 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Higd1bQ99JY6 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Higd1bQ99JY6 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Higd1bQ99JY6 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Higd1bQ99JY6 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Higd1bQ99JY6 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Higd1bQ99JY6 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Higd1bQ99JY6 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Higd1bQ99JY6 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Higd1bQ99JY6 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Higd1bQ99JY6 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Higd1bQ99JY6 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Higd1bQ99JY6 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Higd1bQ99JY6 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Higd1bQ99JY6 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Higd1bQ99JY6 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Higd1bQ99JY6 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Higd1bQ99JY6 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Higd1bQ99JY6 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Higd1bQ99JY6 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Higd1bQ99JY6 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Higd1bQ99JY6 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Higd1bQ99JY6 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Higd1bQ99JY6 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Higd1bQ99JY6 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Higd1bQ99JY6 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Higd1bQ99JY6 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Higd1bQ99JY6 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Higd1bQ99JY6 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Higd1bQ99JY6 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Higd1bQ99JY6 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Higd1bQ99JY6 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Higd1bQ99JY6 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Higd1bQ99JY6 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Higd1bQ99JY6 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Higd1bQ99JY6 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Higd1bQ99JY6 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Higd1bQ99JY6 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Higd1bQ99JY6 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Higd1bQ99JY6 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Higd1bQ99JY6 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Higd1bQ99JY6 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Higd1bQ99JY6 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Higd1bQ99JY6 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Higd1bQ99JY6 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Higd1bQ99JY6 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Higd1bQ99JY6 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Higd1bQ99JY6 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Higd1bQ99JY6 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Higd1bQ99JY6 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Higd1bQ99JY6 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Higd1bQ99JY6 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Higd1bQ99JY6 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Higd1bQ99JY6 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Higd1bQ99JY6 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms