Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

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Length 292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Rnf144aQ925F3 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rnf144aQ925F3 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rnf144aQ925F3 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rnf144aQ925F3 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rnf144aQ925F3 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rnf144aQ925F3 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Rnf144aQ925F3 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Rnf144aQ925F3 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rnf144aQ925F3 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rnf144aQ925F3 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rnf144aQ925F3 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rnf144aQ925F3 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rnf144aQ925F3 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rnf144aQ925F3 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Rnf144aQ925F3 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rnf144aQ925F3 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rnf144aQ925F3 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rnf144aQ925F3 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rnf144aQ925F3 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rnf144aQ925F3 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rnf144aQ925F3 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rnf144aQ925F3 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rnf144aQ925F3 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rnf144aQ925F3 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rnf144aQ925F3 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rnf144aQ925F3 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rnf144aQ925F3 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rnf144aQ925F3 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rnf144aQ925F3 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rnf144aQ925F3 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rnf144aQ925F3 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Rnf144aQ925F3 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rnf144aQ925F3 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rnf144aQ925F3 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rnf144aQ925F3 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rnf144aQ925F3 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Rnf144aQ925F3 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rnf144aQ925F3 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rnf144aQ925F3 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rnf144aQ925F3 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rnf144aQ925F3 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rnf144aQ925F3 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rnf144aQ925F3 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rnf144aQ925F3 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rnf144aQ925F3 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rnf144aQ925F3 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rnf144aQ925F3 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rnf144aQ925F3 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rnf144aQ925F3 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rnf144aQ925F3 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rnf144aQ925F3 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rnf144aQ925F3 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rnf144aQ925F3 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rnf144aQ925F3 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rnf144aQ925F3 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rnf144aQ925F3 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rnf144aQ925F3 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rnf144aQ925F3 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
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Rnf144aQ925F3 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
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Rnf144aQ925F3 Gm45609-206ENSMUST00000210176 1023 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rnf144aQ925F3 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rnf144aQ925F3 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rnf144aQ925F3 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rnf144aQ925F3 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rnf144aQ925F3 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
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Rnf144aQ925F3 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rnf144aQ925F3 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rnf144aQ925F3 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rnf144aQ925F3 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rnf144aQ925F3 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rnf144aQ925F3 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rnf144aQ925F3 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rnf144aQ925F3 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rnf144aQ925F3 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rnf144aQ925F3 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rnf144aQ925F3 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rnf144aQ925F3 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rnf144aQ925F3 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rnf144aQ925F3 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rnf144aQ925F3 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rnf144aQ925F3 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rnf144aQ925F3 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rnf144aQ925F3 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rnf144aQ925F3 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rnf144aQ925F3 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rnf144aQ925F3 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rnf144aQ925F3 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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