Protein–RNA interactions for Protein: Q925E8

Sptssb, Serine palmitoyltransferase small subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 76 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SptssbQ925E8 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Arfgef3-201ENSMUST00000019999 5606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Phtf1os-201ENSMUST00000160110 4046 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Limch1-201ENSMUST00000038188 5903 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Wdfy4-202ENSMUST00000130509 10158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Ly75-201ENSMUST00000028362 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Olfr731-203ENSMUST00000214152 5572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Ccdc187-203ENSMUST00000227200 9528 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Serpinc1-201ENSMUST00000064725 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Pml-207ENSMUST00000135310 4413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Rp1l1-201ENSMUST00000058229 6684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 R3hdm2-201ENSMUST00000064793 4175 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Timd4-201ENSMUST00000068877 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Tsc22d4-202ENSMUST00000100539 3983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Afap1-201ENSMUST00000064571 6618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Ikbkg-201ENSMUST00000004330 6918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Prr5l-210ENSMUST00000171088 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Pkd1-201ENSMUST00000035565 14164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
SptssbQ925E8 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Urb1-203ENSMUST00000140920 7344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms