Protein–RNA interactions for Protein: Q91W18

Tdrd3, Tudor domain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 743 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd3Q91W18 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tdrd3Q91W18 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tdrd3Q91W18 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tdrd3Q91W18 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tdrd3Q91W18 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tdrd3Q91W18 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tdrd3Q91W18 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tdrd3Q91W18 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Tdrd3Q91W18 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tdrd3Q91W18 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tdrd3Q91W18 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tdrd3Q91W18 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tdrd3Q91W18 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tdrd3Q91W18 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tdrd3Q91W18 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tdrd3Q91W18 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tdrd3Q91W18 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tdrd3Q91W18 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tdrd3Q91W18 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tdrd3Q91W18 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tdrd3Q91W18 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tdrd3Q91W18 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tdrd3Q91W18 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tdrd3Q91W18 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tdrd3Q91W18 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tdrd3Q91W18 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tdrd3Q91W18 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Tdrd3Q91W18 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tdrd3Q91W18 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tdrd3Q91W18 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Tdrd3Q91W18 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tdrd3Q91W18 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Tdrd3Q91W18 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tdrd3Q91W18 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tdrd3Q91W18 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Tdrd3Q91W18 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tdrd3Q91W18 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Tdrd3Q91W18 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tdrd3Q91W18 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tdrd3Q91W18 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tdrd3Q91W18 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tdrd3Q91W18 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tdrd3Q91W18 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Tdrd3Q91W18 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Tdrd3Q91W18 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tdrd3Q91W18 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tdrd3Q91W18 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tdrd3Q91W18 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tdrd3Q91W18 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tdrd3Q91W18 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tdrd3Q91W18 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tdrd3Q91W18 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tdrd3Q91W18 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tdrd3Q91W18 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tdrd3Q91W18 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tdrd3Q91W18 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tdrd3Q91W18 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tdrd3Q91W18 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tdrd3Q91W18 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tdrd3Q91W18 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tdrd3Q91W18 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tdrd3Q91W18 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tdrd3Q91W18 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tdrd3Q91W18 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tdrd3Q91W18 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tdrd3Q91W18 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tdrd3Q91W18 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Tdrd3Q91W18 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tdrd3Q91W18 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Tdrd3Q91W18 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tdrd3Q91W18 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tdrd3Q91W18 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tdrd3Q91W18 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tdrd3Q91W18 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tdrd3Q91W18 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Tdrd3Q91W18 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tdrd3Q91W18 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tdrd3Q91W18 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tdrd3Q91W18 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tdrd3Q91W18 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tdrd3Q91W18 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tdrd3Q91W18 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tdrd3Q91W18 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tdrd3Q91W18 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Tdrd3Q91W18 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Tdrd3Q91W18 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tdrd3Q91W18 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tdrd3Q91W18 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tdrd3Q91W18 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tdrd3Q91W18 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tdrd3Q91W18 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tdrd3Q91W18 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tdrd3Q91W18 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Tdrd3Q91W18 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Tdrd3Q91W18 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tdrd3Q91W18 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tdrd3Q91W18 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tdrd3Q91W18 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tdrd3Q91W18 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tdrd3Q91W18 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms