Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS4

Rprd1a, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1A, mousemouse

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1aQ8VDS4 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rprd1aQ8VDS4 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rprd1aQ8VDS4 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rprd1aQ8VDS4 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rprd1aQ8VDS4 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rprd1aQ8VDS4 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rprd1aQ8VDS4 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rprd1aQ8VDS4 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rprd1aQ8VDS4 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rprd1aQ8VDS4 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rprd1aQ8VDS4 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rprd1aQ8VDS4 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rprd1aQ8VDS4 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rprd1aQ8VDS4 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rprd1aQ8VDS4 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rprd1aQ8VDS4 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rprd1aQ8VDS4 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rprd1aQ8VDS4 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rprd1aQ8VDS4 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rprd1aQ8VDS4 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rprd1aQ8VDS4 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rprd1aQ8VDS4 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rprd1aQ8VDS4 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rprd1aQ8VDS4 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rprd1aQ8VDS4 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rprd1aQ8VDS4 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rprd1aQ8VDS4 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rprd1aQ8VDS4 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rprd1aQ8VDS4 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rprd1aQ8VDS4 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rprd1aQ8VDS4 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rprd1aQ8VDS4 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rprd1aQ8VDS4 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rprd1aQ8VDS4 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Rprd1aQ8VDS4 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Rprd1aQ8VDS4 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rprd1aQ8VDS4 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rprd1aQ8VDS4 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Rprd1aQ8VDS4 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rprd1aQ8VDS4 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rprd1aQ8VDS4 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rprd1aQ8VDS4 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rprd1aQ8VDS4 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rprd1aQ8VDS4 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rprd1aQ8VDS4 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rprd1aQ8VDS4 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rprd1aQ8VDS4 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Rprd1aQ8VDS4 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Rprd1aQ8VDS4 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rprd1aQ8VDS4 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Rprd1aQ8VDS4 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rprd1aQ8VDS4 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Rprd1aQ8VDS4 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rprd1aQ8VDS4 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Rprd1aQ8VDS4 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rprd1aQ8VDS4 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rprd1aQ8VDS4 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Rprd1aQ8VDS4 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rprd1aQ8VDS4 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rprd1aQ8VDS4 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rprd1aQ8VDS4 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rprd1aQ8VDS4 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rprd1aQ8VDS4 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Rprd1aQ8VDS4 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rprd1aQ8VDS4 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Rprd1aQ8VDS4 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Rprd1aQ8VDS4 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rprd1aQ8VDS4 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rprd1aQ8VDS4 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rprd1aQ8VDS4 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rprd1aQ8VDS4 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rprd1aQ8VDS4 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rprd1aQ8VDS4 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rprd1aQ8VDS4 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rprd1aQ8VDS4 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rprd1aQ8VDS4 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rprd1aQ8VDS4 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rprd1aQ8VDS4 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rprd1aQ8VDS4 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rprd1aQ8VDS4 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rprd1aQ8VDS4 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rprd1aQ8VDS4 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rprd1aQ8VDS4 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Rprd1aQ8VDS4 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rprd1aQ8VDS4 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rprd1aQ8VDS4 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rprd1aQ8VDS4 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rprd1aQ8VDS4 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rprd1aQ8VDS4 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Rprd1aQ8VDS4 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rprd1aQ8VDS4 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Rprd1aQ8VDS4 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Rprd1aQ8VDS4 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Rprd1aQ8VDS4 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rprd1aQ8VDS4 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rprd1aQ8VDS4 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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