Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH7

Rdh10, Retinol dehydrogenase 10, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh10Q8VCH7 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rdh10Q8VCH7 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rdh10Q8VCH7 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rdh10Q8VCH7 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rdh10Q8VCH7 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rdh10Q8VCH7 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Rdh10Q8VCH7 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Rdh10Q8VCH7 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
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Rdh10Q8VCH7 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rdh10Q8VCH7 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rdh10Q8VCH7 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rdh10Q8VCH7 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rdh10Q8VCH7 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rdh10Q8VCH7 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rdh10Q8VCH7 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rdh10Q8VCH7 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rdh10Q8VCH7 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rdh10Q8VCH7 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rdh10Q8VCH7 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rdh10Q8VCH7 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rdh10Q8VCH7 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rdh10Q8VCH7 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Rdh10Q8VCH7 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rdh10Q8VCH7 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rdh10Q8VCH7 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rdh10Q8VCH7 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Rdh10Q8VCH7 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rdh10Q8VCH7 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rdh10Q8VCH7 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rdh10Q8VCH7 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rdh10Q8VCH7 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Rdh10Q8VCH7 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rdh10Q8VCH7 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rdh10Q8VCH7 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rdh10Q8VCH7 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rdh10Q8VCH7 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rdh10Q8VCH7 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rdh10Q8VCH7 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Rdh10Q8VCH7 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Rdh10Q8VCH7 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Rdh10Q8VCH7 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rdh10Q8VCH7 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rdh10Q8VCH7 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Rdh10Q8VCH7 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Rdh10Q8VCH7 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rdh10Q8VCH7 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rdh10Q8VCH7 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rdh10Q8VCH7 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rdh10Q8VCH7 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rdh10Q8VCH7 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rdh10Q8VCH7 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rdh10Q8VCH7 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rdh10Q8VCH7 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rdh10Q8VCH7 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rdh10Q8VCH7 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rdh10Q8VCH7 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rdh10Q8VCH7 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rdh10Q8VCH7 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rdh10Q8VCH7 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rdh10Q8VCH7 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rdh10Q8VCH7 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rdh10Q8VCH7 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rdh10Q8VCH7 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rdh10Q8VCH7 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rdh10Q8VCH7 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rdh10Q8VCH7 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rdh10Q8VCH7 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rdh10Q8VCH7 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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