Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4U6

Top1mt, DNA topoisomerase I, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1mtQ8R4U6 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Top1mtQ8R4U6 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Top1mtQ8R4U6 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Top1mtQ8R4U6 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Top1mtQ8R4U6 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Top1mtQ8R4U6 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Top1mtQ8R4U6 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Top1mtQ8R4U6 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Top1mtQ8R4U6 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Top1mtQ8R4U6 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Top1mtQ8R4U6 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Top1mtQ8R4U6 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Top1mtQ8R4U6 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Top1mtQ8R4U6 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Top1mtQ8R4U6 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Top1mtQ8R4U6 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Top1mtQ8R4U6 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Top1mtQ8R4U6 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Top1mtQ8R4U6 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Top1mtQ8R4U6 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Top1mtQ8R4U6 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Top1mtQ8R4U6 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Top1mtQ8R4U6 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Top1mtQ8R4U6 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Top1mtQ8R4U6 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Top1mtQ8R4U6 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Top1mtQ8R4U6 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Top1mtQ8R4U6 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Top1mtQ8R4U6 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Top1mtQ8R4U6 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Top1mtQ8R4U6 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Top1mtQ8R4U6 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Top1mtQ8R4U6 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Top1mtQ8R4U6 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Top1mtQ8R4U6 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Top1mtQ8R4U6 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Top1mtQ8R4U6 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Top1mtQ8R4U6 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Top1mtQ8R4U6 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Top1mtQ8R4U6 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Top1mtQ8R4U6 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Top1mtQ8R4U6 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Top1mtQ8R4U6 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Top1mtQ8R4U6 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Top1mtQ8R4U6 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Top1mtQ8R4U6 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Top1mtQ8R4U6 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Top1mtQ8R4U6 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Top1mtQ8R4U6 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Top1mtQ8R4U6 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Top1mtQ8R4U6 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Top1mtQ8R4U6 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Top1mtQ8R4U6 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Top1mtQ8R4U6 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Top1mtQ8R4U6 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Top1mtQ8R4U6 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Top1mtQ8R4U6 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Top1mtQ8R4U6 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Top1mtQ8R4U6 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Top1mtQ8R4U6 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Top1mtQ8R4U6 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Top1mtQ8R4U6 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Top1mtQ8R4U6 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Top1mtQ8R4U6 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Top1mtQ8R4U6 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Top1mtQ8R4U6 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Top1mtQ8R4U6 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Top1mtQ8R4U6 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Top1mtQ8R4U6 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Top1mtQ8R4U6 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Top1mtQ8R4U6 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Top1mtQ8R4U6 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Top1mtQ8R4U6 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Top1mtQ8R4U6 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Top1mtQ8R4U6 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Top1mtQ8R4U6 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Top1mtQ8R4U6 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Top1mtQ8R4U6 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Top1mtQ8R4U6 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Top1mtQ8R4U6 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Top1mtQ8R4U6 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Top1mtQ8R4U6 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Top1mtQ8R4U6 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Top1mtQ8R4U6 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Top1mtQ8R4U6 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Top1mtQ8R4U6 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Top1mtQ8R4U6 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Top1mtQ8R4U6 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Top1mtQ8R4U6 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Top1mtQ8R4U6 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Top1mtQ8R4U6 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Top1mtQ8R4U6 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Top1mtQ8R4U6 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Top1mtQ8R4U6 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Top1mtQ8R4U6 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Top1mtQ8R4U6 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Top1mtQ8R4U6 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Top1mtQ8R4U6 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Top1mtQ8R4U6 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Top1mtQ8R4U6 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms