Protein–RNA interactions for Protein: Q8R281

Vmn1r200, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r200Q8R281 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vmn1r200Q8R281 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vmn1r200Q8R281 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vmn1r200Q8R281 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vmn1r200Q8R281 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vmn1r200Q8R281 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vmn1r200Q8R281 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vmn1r200Q8R281 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vmn1r200Q8R281 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vmn1r200Q8R281 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vmn1r200Q8R281 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vmn1r200Q8R281 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vmn1r200Q8R281 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Vmn1r200Q8R281 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
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Vmn1r200Q8R281 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vmn1r200Q8R281 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vmn1r200Q8R281 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Vmn1r200Q8R281 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
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Vmn1r200Q8R281 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vmn1r200Q8R281 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vmn1r200Q8R281 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Vmn1r200Q8R281 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
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Vmn1r200Q8R281 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vmn1r200Q8R281 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vmn1r200Q8R281 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vmn1r200Q8R281 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vmn1r200Q8R281 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vmn1r200Q8R281 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vmn1r200Q8R281 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vmn1r200Q8R281 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vmn1r200Q8R281 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vmn1r200Q8R281 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vmn1r200Q8R281 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Vmn1r200Q8R281 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
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Vmn1r200Q8R281 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vmn1r200Q8R281 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vmn1r200Q8R281 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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Vmn1r200Q8R281 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vmn1r200Q8R281 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
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Vmn1r200Q8R281 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vmn1r200Q8R281 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
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Vmn1r200Q8R281 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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Vmn1r200Q8R281 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vmn1r200Q8R281 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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Vmn1r200Q8R281 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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Vmn1r200Q8R281 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vmn1r200Q8R281 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vmn1r200Q8R281 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vmn1r200Q8R281 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vmn1r200Q8R281 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vmn1r200Q8R281 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vmn1r200Q8R281 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vmn1r200Q8R281 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vmn1r200Q8R281 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vmn1r200Q8R281 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vmn1r200Q8R281 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vmn1r200Q8R281 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Vmn1r200Q8R281 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vmn1r200Q8R281 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Vmn1r200Q8R281 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vmn1r200Q8R281 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vmn1r200Q8R281 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vmn1r200Q8R281 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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