Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZS5

Rnf183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, mousemouse

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Length 190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf183Q8QZS5 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rnf183Q8QZS5 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rnf183Q8QZS5 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rnf183Q8QZS5 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rnf183Q8QZS5 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rnf183Q8QZS5 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rnf183Q8QZS5 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rnf183Q8QZS5 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rnf183Q8QZS5 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rnf183Q8QZS5 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rnf183Q8QZS5 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rnf183Q8QZS5 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rnf183Q8QZS5 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rnf183Q8QZS5 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rnf183Q8QZS5 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rnf183Q8QZS5 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rnf183Q8QZS5 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rnf183Q8QZS5 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Rnf183Q8QZS5 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Rnf183Q8QZS5 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rnf183Q8QZS5 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rnf183Q8QZS5 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rnf183Q8QZS5 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Rnf183Q8QZS5 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rnf183Q8QZS5 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Rnf183Q8QZS5 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rnf183Q8QZS5 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rnf183Q8QZS5 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rnf183Q8QZS5 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rnf183Q8QZS5 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
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Rnf183Q8QZS5 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rnf183Q8QZS5 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rnf183Q8QZS5 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rnf183Q8QZS5 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rnf183Q8QZS5 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rnf183Q8QZS5 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rnf183Q8QZS5 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Rnf183Q8QZS5 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rnf183Q8QZS5 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rnf183Q8QZS5 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rnf183Q8QZS5 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rnf183Q8QZS5 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rnf183Q8QZS5 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rnf183Q8QZS5 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rnf183Q8QZS5 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rnf183Q8QZS5 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rnf183Q8QZS5 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rnf183Q8QZS5 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rnf183Q8QZS5 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
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Rnf183Q8QZS5 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rnf183Q8QZS5 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rnf183Q8QZS5 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rnf183Q8QZS5 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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Rnf183Q8QZS5 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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Rnf183Q8QZS5 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rnf183Q8QZS5 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rnf183Q8QZS5 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rnf183Q8QZS5 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rnf183Q8QZS5 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rnf183Q8QZS5 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rnf183Q8QZS5 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rnf183Q8QZS5 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rnf183Q8QZS5 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rnf183Q8QZS5 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rnf183Q8QZS5 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rnf183Q8QZS5 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rnf183Q8QZS5 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rnf183Q8QZS5 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rnf183Q8QZS5 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rnf183Q8QZS5 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rnf183Q8QZS5 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rnf183Q8QZS5 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rnf183Q8QZS5 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Rnf183Q8QZS5 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Rnf183Q8QZS5 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Rnf183Q8QZS5 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Rnf183Q8QZS5 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Rnf183Q8QZS5 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
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