Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

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Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
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Hoxc12Q8K5B8 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxc12Q8K5B8 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxc12Q8K5B8 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxc12Q8K5B8 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxc12Q8K5B8 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxc12Q8K5B8 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxc12Q8K5B8 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Hoxc12Q8K5B8 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxc12Q8K5B8 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxc12Q8K5B8 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxc12Q8K5B8 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxc12Q8K5B8 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxc12Q8K5B8 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxc12Q8K5B8 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxc12Q8K5B8 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxc12Q8K5B8 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxc12Q8K5B8 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxc12Q8K5B8 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxc12Q8K5B8 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxc12Q8K5B8 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxc12Q8K5B8 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxc12Q8K5B8 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
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Hoxc12Q8K5B8 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
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Hoxc12Q8K5B8 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Hoxc12Q8K5B8 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Hoxc12Q8K5B8 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Hoxc12Q8K5B8 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Hoxc12Q8K5B8 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Hoxc12Q8K5B8 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Hoxc12Q8K5B8 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Hoxc12Q8K5B8 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
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Hoxc12Q8K5B8 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
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