Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3G5

Vrk3, Inactive serine/threonine-protein kinase VRK3, mousemouse

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vrk3Q8K3G5 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vrk3Q8K3G5 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vrk3Q8K3G5 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vrk3Q8K3G5 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vrk3Q8K3G5 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vrk3Q8K3G5 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vrk3Q8K3G5 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vrk3Q8K3G5 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vrk3Q8K3G5 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vrk3Q8K3G5 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vrk3Q8K3G5 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vrk3Q8K3G5 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vrk3Q8K3G5 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vrk3Q8K3G5 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vrk3Q8K3G5 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vrk3Q8K3G5 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vrk3Q8K3G5 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vrk3Q8K3G5 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vrk3Q8K3G5 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vrk3Q8K3G5 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vrk3Q8K3G5 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vrk3Q8K3G5 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vrk3Q8K3G5 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Vrk3Q8K3G5 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Vrk3Q8K3G5 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vrk3Q8K3G5 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vrk3Q8K3G5 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Vrk3Q8K3G5 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vrk3Q8K3G5 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vrk3Q8K3G5 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vrk3Q8K3G5 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vrk3Q8K3G5 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vrk3Q8K3G5 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vrk3Q8K3G5 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vrk3Q8K3G5 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vrk3Q8K3G5 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vrk3Q8K3G5 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vrk3Q8K3G5 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vrk3Q8K3G5 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vrk3Q8K3G5 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vrk3Q8K3G5 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vrk3Q8K3G5 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vrk3Q8K3G5 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vrk3Q8K3G5 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vrk3Q8K3G5 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vrk3Q8K3G5 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vrk3Q8K3G5 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vrk3Q8K3G5 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vrk3Q8K3G5 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vrk3Q8K3G5 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vrk3Q8K3G5 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vrk3Q8K3G5 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vrk3Q8K3G5 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vrk3Q8K3G5 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vrk3Q8K3G5 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vrk3Q8K3G5 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vrk3Q8K3G5 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vrk3Q8K3G5 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vrk3Q8K3G5 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vrk3Q8K3G5 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vrk3Q8K3G5 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vrk3Q8K3G5 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vrk3Q8K3G5 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vrk3Q8K3G5 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vrk3Q8K3G5 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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Vrk3Q8K3G5 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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Vrk3Q8K3G5 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
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Vrk3Q8K3G5 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vrk3Q8K3G5 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vrk3Q8K3G5 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vrk3Q8K3G5 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vrk3Q8K3G5 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vrk3Q8K3G5 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vrk3Q8K3G5 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vrk3Q8K3G5 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vrk3Q8K3G5 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vrk3Q8K3G5 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vrk3Q8K3G5 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vrk3Q8K3G5 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vrk3Q8K3G5 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vrk3Q8K3G5 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Vrk3Q8K3G5 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Vrk3Q8K3G5 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
Vrk3Q8K3G5 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Vrk3Q8K3G5 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vrk3Q8K3G5 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vrk3Q8K3G5 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vrk3Q8K3G5 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vrk3Q8K3G5 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vrk3Q8K3G5 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Vrk3Q8K3G5 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vrk3Q8K3G5 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vrk3Q8K3G5 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Vrk3Q8K3G5 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
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