Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3A2

Trpt1, tRNA 2'-phosphotransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpt1Q8K3A2 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Trpt1Q8K3A2 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trpt1Q8K3A2 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trpt1Q8K3A2 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trpt1Q8K3A2 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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Trpt1Q8K3A2 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
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Trpt1Q8K3A2 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
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