Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Prpf39Q8K2Z2 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Prpf39Q8K2Z2 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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