Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Abcf3Q8K268 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Abcf3Q8K268 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Abcf3Q8K268 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Abcf3Q8K268 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Abcf3Q8K268 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Abcf3Q8K268 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Abcf3Q8K268 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Abcf3Q8K268 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Abcf3Q8K268 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Abcf3Q8K268 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Abcf3Q8K268 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Abcf3Q8K268 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Abcf3Q8K268 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Abcf3Q8K268 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Abcf3Q8K268 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Abcf3Q8K268 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Abcf3Q8K268 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Abcf3Q8K268 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Abcf3Q8K268 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Abcf3Q8K268 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Abcf3Q8K268 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Abcf3Q8K268 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Abcf3Q8K268 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Abcf3Q8K268 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Abcf3Q8K268 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Abcf3Q8K268 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Abcf3Q8K268 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Abcf3Q8K268 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Abcf3Q8K268 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Abcf3Q8K268 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Abcf3Q8K268 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Abcf3Q8K268 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Abcf3Q8K268 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Abcf3Q8K268 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Abcf3Q8K268 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Abcf3Q8K268 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Abcf3Q8K268 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Abcf3Q8K268 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Abcf3Q8K268 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Abcf3Q8K268 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Abcf3Q8K268 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Abcf3Q8K268 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Abcf3Q8K268 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Abcf3Q8K268 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Abcf3Q8K268 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Abcf3Q8K268 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Abcf3Q8K268 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Abcf3Q8K268 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Abcf3Q8K268 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Abcf3Q8K268 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Abcf3Q8K268 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Abcf3Q8K268 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Abcf3Q8K268 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Abcf3Q8K268 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Abcf3Q8K268 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Abcf3Q8K268 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Abcf3Q8K268 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Abcf3Q8K268 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Abcf3Q8K268 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Abcf3Q8K268 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Abcf3Q8K268 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Abcf3Q8K268 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Abcf3Q8K268 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Abcf3Q8K268 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Abcf3Q8K268 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Abcf3Q8K268 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Abcf3Q8K268 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Abcf3Q8K268 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Abcf3Q8K268 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Abcf3Q8K268 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Abcf3Q8K268 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Abcf3Q8K268 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Abcf3Q8K268 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Abcf3Q8K268 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Abcf3Q8K268 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Abcf3Q8K268 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Abcf3Q8K268 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Abcf3Q8K268 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Abcf3Q8K268 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Abcf3Q8K268 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Abcf3Q8K268 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Abcf3Q8K268 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Abcf3Q8K268 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Abcf3Q8K268 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Abcf3Q8K268 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Abcf3Q8K268 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Abcf3Q8K268 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Abcf3Q8K268 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Abcf3Q8K268 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Abcf3Q8K268 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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