Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx8Q8CFD4 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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