Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEI3

Ccdc28a, Coiled-coil domain-containing 28A, mousemouse

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Length 192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28aQ8CEI3 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ccdc28aQ8CEI3 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ccdc28aQ8CEI3 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ccdc28aQ8CEI3 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Ccdc28aQ8CEI3 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ccdc28aQ8CEI3 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ccdc28aQ8CEI3 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ccdc28aQ8CEI3 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc28aQ8CEI3 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc28aQ8CEI3 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc28aQ8CEI3 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc28aQ8CEI3 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc28aQ8CEI3 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc28aQ8CEI3 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc28aQ8CEI3 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc28aQ8CEI3 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc28aQ8CEI3 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc28aQ8CEI3 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc28aQ8CEI3 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc28aQ8CEI3 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc28aQ8CEI3 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc28aQ8CEI3 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc28aQ8CEI3 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc28aQ8CEI3 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc28aQ8CEI3 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc28aQ8CEI3 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc28aQ8CEI3 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc28aQ8CEI3 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc28aQ8CEI3 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc28aQ8CEI3 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc28aQ8CEI3 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc28aQ8CEI3 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc28aQ8CEI3 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc28aQ8CEI3 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc28aQ8CEI3 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc28aQ8CEI3 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc28aQ8CEI3 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc28aQ8CEI3 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc28aQ8CEI3 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc28aQ8CEI3 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc28aQ8CEI3 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc28aQ8CEI3 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc28aQ8CEI3 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc28aQ8CEI3 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc28aQ8CEI3 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc28aQ8CEI3 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc28aQ8CEI3 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc28aQ8CEI3 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc28aQ8CEI3 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc28aQ8CEI3 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc28aQ8CEI3 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc28aQ8CEI3 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc28aQ8CEI3 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc28aQ8CEI3 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc28aQ8CEI3 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc28aQ8CEI3 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc28aQ8CEI3 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc28aQ8CEI3 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc28aQ8CEI3 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc28aQ8CEI3 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc28aQ8CEI3 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc28aQ8CEI3 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc28aQ8CEI3 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc28aQ8CEI3 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc28aQ8CEI3 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc28aQ8CEI3 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc28aQ8CEI3 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc28aQ8CEI3 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc28aQ8CEI3 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc28aQ8CEI3 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc28aQ8CEI3 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc28aQ8CEI3 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc28aQ8CEI3 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc28aQ8CEI3 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc28aQ8CEI3 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc28aQ8CEI3 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc28aQ8CEI3 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc28aQ8CEI3 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc28aQ8CEI3 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc28aQ8CEI3 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc28aQ8CEI3 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc28aQ8CEI3 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc28aQ8CEI3 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc28aQ8CEI3 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc28aQ8CEI3 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc28aQ8CEI3 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc28aQ8CEI3 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc28aQ8CEI3 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc28aQ8CEI3 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc28aQ8CEI3 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc28aQ8CEI3 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc28aQ8CEI3 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc28aQ8CEI3 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc28aQ8CEI3 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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