Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN9

Lrrc9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc9Q8CDN9 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Lrrc9Q8CDN9 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Lrrc9Q8CDN9 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lrrc9Q8CDN9 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Lrrc9Q8CDN9 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lrrc9Q8CDN9 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Lrrc9Q8CDN9 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lrrc9Q8CDN9 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lrrc9Q8CDN9 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Lrrc9Q8CDN9 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lrrc9Q8CDN9 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lrrc9Q8CDN9 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lrrc9Q8CDN9 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lrrc9Q8CDN9 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lrrc9Q8CDN9 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lrrc9Q8CDN9 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lrrc9Q8CDN9 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lrrc9Q8CDN9 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lrrc9Q8CDN9 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lrrc9Q8CDN9 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lrrc9Q8CDN9 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lrrc9Q8CDN9 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lrrc9Q8CDN9 Spata3-207ENSMUST00000135440 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lrrc9Q8CDN9 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Lrrc9Q8CDN9 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lrrc9Q8CDN9 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Lrrc9Q8CDN9 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lrrc9Q8CDN9 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Lrrc9Q8CDN9 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Lrrc9Q8CDN9 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lrrc9Q8CDN9 Spata3-201ENSMUST00000052854 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lrrc9Q8CDN9 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lrrc9Q8CDN9 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lrrc9Q8CDN9 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lrrc9Q8CDN9 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Lrrc9Q8CDN9 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lrrc9Q8CDN9 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lrrc9Q8CDN9 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lrrc9Q8CDN9 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lrrc9Q8CDN9 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lrrc9Q8CDN9 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lrrc9Q8CDN9 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Lrrc9Q8CDN9 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lrrc9Q8CDN9 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Lrrc9Q8CDN9 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lrrc9Q8CDN9 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lrrc9Q8CDN9 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lrrc9Q8CDN9 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lrrc9Q8CDN9 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lrrc9Q8CDN9 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lrrc9Q8CDN9 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lrrc9Q8CDN9 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lrrc9Q8CDN9 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Lrrc9Q8CDN9 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lrrc9Q8CDN9 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lrrc9Q8CDN9 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lrrc9Q8CDN9 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lrrc9Q8CDN9 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lrrc9Q8CDN9 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lrrc9Q8CDN9 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lrrc9Q8CDN9 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lrrc9Q8CDN9 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lrrc9Q8CDN9 Sun3-202ENSMUST00000102909 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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Lrrc9Q8CDN9 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lrrc9Q8CDN9 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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Lrrc9Q8CDN9 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lrrc9Q8CDN9 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lrrc9Q8CDN9 Mir483-201ENSMUST00000093631 73 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Lrrc9Q8CDN9 Rgs6-207ENSMUST00000186323 1308 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lrrc9Q8CDN9 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lrrc9Q8CDN9 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lrrc9Q8CDN9 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lrrc9Q8CDN9 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lrrc9Q8CDN9 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lrrc9Q8CDN9 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lrrc9Q8CDN9 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lrrc9Q8CDN9 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lrrc9Q8CDN9 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lrrc9Q8CDN9 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lrrc9Q8CDN9 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Lrrc9Q8CDN9 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lrrc9Q8CDN9 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lrrc9Q8CDN9 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Lrrc9Q8CDN9 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Lrrc9Q8CDN9 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Lrrc9Q8CDN9 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Lrrc9Q8CDN9 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Lrrc9Q8CDN9 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lrrc9Q8CDN9 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lrrc9Q8CDN9 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Lrrc9Q8CDN9 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lrrc9Q8CDN9 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lrrc9Q8CDN9 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lrrc9Q8CDN9 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lrrc9Q8CDN9 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms