Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Nhlrc3Q8CCH2 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Nhlrc3Q8CCH2 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Nhlrc3Q8CCH2 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Nhlrc3Q8CCH2 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Nhlrc3Q8CCH2 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Nhlrc3Q8CCH2 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Nhlrc3Q8CCH2 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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