Protein–RNA interactions for Protein: Q8CB62

Cntrob, Centrobin, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntrobQ8CB62 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
CntrobQ8CB62 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
CntrobQ8CB62 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
CntrobQ8CB62 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CntrobQ8CB62 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CntrobQ8CB62 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CntrobQ8CB62 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CntrobQ8CB62 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CntrobQ8CB62 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CntrobQ8CB62 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CntrobQ8CB62 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CntrobQ8CB62 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CntrobQ8CB62 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CntrobQ8CB62 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
CntrobQ8CB62 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CntrobQ8CB62 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CntrobQ8CB62 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CntrobQ8CB62 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CntrobQ8CB62 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CntrobQ8CB62 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CntrobQ8CB62 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CntrobQ8CB62 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CntrobQ8CB62 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CntrobQ8CB62 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CntrobQ8CB62 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CntrobQ8CB62 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CntrobQ8CB62 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CntrobQ8CB62 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CntrobQ8CB62 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CntrobQ8CB62 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CntrobQ8CB62 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CntrobQ8CB62 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CntrobQ8CB62 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CntrobQ8CB62 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CntrobQ8CB62 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CntrobQ8CB62 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CntrobQ8CB62 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CntrobQ8CB62 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CntrobQ8CB62 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CntrobQ8CB62 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CntrobQ8CB62 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CntrobQ8CB62 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CntrobQ8CB62 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CntrobQ8CB62 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CntrobQ8CB62 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CntrobQ8CB62 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CntrobQ8CB62 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CntrobQ8CB62 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CntrobQ8CB62 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CntrobQ8CB62 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CntrobQ8CB62 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CntrobQ8CB62 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CntrobQ8CB62 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CntrobQ8CB62 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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CntrobQ8CB62 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CntrobQ8CB62 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CntrobQ8CB62 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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CntrobQ8CB62 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
CntrobQ8CB62 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
CntrobQ8CB62 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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CntrobQ8CB62 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CntrobQ8CB62 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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CntrobQ8CB62 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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CntrobQ8CB62 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CntrobQ8CB62 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CntrobQ8CB62 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CntrobQ8CB62 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CntrobQ8CB62 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CntrobQ8CB62 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CntrobQ8CB62 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CntrobQ8CB62 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CntrobQ8CB62 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CntrobQ8CB62 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CntrobQ8CB62 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CntrobQ8CB62 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CntrobQ8CB62 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CntrobQ8CB62 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CntrobQ8CB62 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CntrobQ8CB62 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CntrobQ8CB62 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CntrobQ8CB62 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CntrobQ8CB62 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CntrobQ8CB62 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CntrobQ8CB62 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CntrobQ8CB62 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CntrobQ8CB62 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CntrobQ8CB62 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CntrobQ8CB62 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CntrobQ8CB62 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CntrobQ8CB62 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms