Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5L3

Cnot2, CCR4-NOT transcription complex subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot2Q8C5L3 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cnot2Q8C5L3 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cnot2Q8C5L3 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cnot2Q8C5L3 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cnot2Q8C5L3 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Cnot2Q8C5L3 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cnot2Q8C5L3 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cnot2Q8C5L3 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Cnot2Q8C5L3 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cnot2Q8C5L3 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cnot2Q8C5L3 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cnot2Q8C5L3 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cnot2Q8C5L3 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cnot2Q8C5L3 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cnot2Q8C5L3 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cnot2Q8C5L3 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cnot2Q8C5L3 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cnot2Q8C5L3 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cnot2Q8C5L3 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cnot2Q8C5L3 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cnot2Q8C5L3 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cnot2Q8C5L3 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cnot2Q8C5L3 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cnot2Q8C5L3 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cnot2Q8C5L3 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cnot2Q8C5L3 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cnot2Q8C5L3 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cnot2Q8C5L3 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cnot2Q8C5L3 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cnot2Q8C5L3 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cnot2Q8C5L3 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cnot2Q8C5L3 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cnot2Q8C5L3 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cnot2Q8C5L3 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cnot2Q8C5L3 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cnot2Q8C5L3 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cnot2Q8C5L3 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cnot2Q8C5L3 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cnot2Q8C5L3 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cnot2Q8C5L3 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cnot2Q8C5L3 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cnot2Q8C5L3 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Cnot2Q8C5L3 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cnot2Q8C5L3 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cnot2Q8C5L3 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cnot2Q8C5L3 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Cnot2Q8C5L3 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cnot2Q8C5L3 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cnot2Q8C5L3 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cnot2Q8C5L3 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cnot2Q8C5L3 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cnot2Q8C5L3 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cnot2Q8C5L3 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cnot2Q8C5L3 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cnot2Q8C5L3 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cnot2Q8C5L3 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cnot2Q8C5L3 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cnot2Q8C5L3 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cnot2Q8C5L3 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cnot2Q8C5L3 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cnot2Q8C5L3 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cnot2Q8C5L3 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cnot2Q8C5L3 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cnot2Q8C5L3 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cnot2Q8C5L3 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cnot2Q8C5L3 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cnot2Q8C5L3 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cnot2Q8C5L3 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cnot2Q8C5L3 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cnot2Q8C5L3 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cnot2Q8C5L3 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cnot2Q8C5L3 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cnot2Q8C5L3 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cnot2Q8C5L3 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cnot2Q8C5L3 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cnot2Q8C5L3 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cnot2Q8C5L3 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cnot2Q8C5L3 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cnot2Q8C5L3 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cnot2Q8C5L3 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cnot2Q8C5L3 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cnot2Q8C5L3 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cnot2Q8C5L3 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cnot2Q8C5L3 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cnot2Q8C5L3 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cnot2Q8C5L3 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cnot2Q8C5L3 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cnot2Q8C5L3 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cnot2Q8C5L3 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cnot2Q8C5L3 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cnot2Q8C5L3 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cnot2Q8C5L3 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cnot2Q8C5L3 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Cnot2Q8C5L3 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cnot2Q8C5L3 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cnot2Q8C5L3 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cnot2Q8C5L3 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Cnot2Q8C5L3 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cnot2Q8C5L3 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Cnot2Q8C5L3 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms